2007年，注冊(cè)資本5000萬(wàn)的申通快遞有限公司（以下簡(jiǎn)稱"申通快遞"）、擁有注冊(cè)商標(biāo)"STO申通快遞"成立，是申通快遞網(wǎng)絡(luò)的總部。申通快遞負(fù)責(zé)對(duì)申通快遞網(wǎng)絡(luò)加盟商的授權(quán)許可、經(jīng)營(yíng)指導(dǎo)、品牌管理等。目前，申通快遞擔(dān)任中國(guó)快遞協(xié)會(huì)、上海快遞行業(yè)協(xié)會(huì)和浙江快遞行業(yè)協(xié)會(huì)副會(huì)長(zhǎng)單位，旗下的加盟商在各個(gè)省份也分別擔(dān)任著副會(huì)長(zhǎng)或理事單位。

1993年，申通快遞品牌創(chuàng)建，是國(guó)內(nèi)早經(jīng)營(yíng)快遞業(yè)務(wù)的品牌之一（跟EMS快遞同等級(jí)），歷經(jīng)十多年的發(fā)展，申通快遞在全國(guó)范圍內(nèi)形成了完善、流暢的自營(yíng)速遞網(wǎng)絡(luò)，基本覆蓋到全國(guó)地市級(jí)以上城市和發(fā)達(dá)地區(qū)縣級(jí)以上城市，尤其是在江浙滬地區(qū)，基本實(shí)現(xiàn)了派送無盲區(qū)。申通快遞在全國(guó)各省市（包括西藏拉薩等偏遠(yuǎn)地區(qū)）有六百多個(gè)一級(jí)加盟商和兩千多個(gè)二級(jí)加盟商、四千多個(gè)門店，50多個(gè)分撥中心，全國(guó)網(wǎng)絡(luò)共有從業(yè)人員四萬(wàn)多名，上萬(wàn)輛干線和支線網(wǎng)絡(luò)車，日均業(yè)務(wù)量近百萬(wàn)票，年?duì)I業(yè)額超過四十億元，成為國(guó)內(nèi)快遞網(wǎng)絡(luò)完整、規(guī)模的民營(yíng)快遞體系。

申通快遞主要提供跨區(qū)域快遞業(yè)務(wù)，市場(chǎng)占有率超過百分之十，使公司成為國(guó)內(nèi)快遞行業(yè)的之一。隨著國(guó)內(nèi)快遞需求的多樣化，公司緊貼市場(chǎng)，不斷進(jìn)行產(chǎn)品創(chuàng)新，繼續(xù)提供傳統(tǒng)快遞服務(wù)的同時(shí)，也在積極開拓新興業(yè)務(wù)，包括第三方物流、電子商務(wù)物流配送服務(wù)和代收貨款業(yè)務(wù)、倉(cāng)儲(chǔ)服務(wù)、貴重物品通道服務(wù)等，目前已經(jīng)成為國(guó)內(nèi)重要的電子商務(wù)物流供應(yīng)商。