一般情況下，非車主本人不可以去車管所申請補辦機動車登記證書。根據(jù)《機動車登記規(guī)定》，機動車登記證書丟失、滅失或者損毀的，機動車所有人應當向登記地車輛管理所申請補領、換領，申請時機動車所有人應當確認申請信息并提交身份證明。

不過，存在一些特殊情況時可以由非車主本人代辦。若機動車所有人因死亡、出境、重病、傷殘或者不可抗力等原因不能到場的，可以憑相關證明委托代理人代理申請，或者由繼承人申請。