(一)兩者格式和記載的內(nèi)容不同
銀行承兌匯票屬于我國《票據(jù)法》規(guī)定的票據(jù)，國內(nèi)信用證是《國內(nèi)信用證結(jié)算辦法》明確的結(jié)算方式，兩者的格式都由人民銀行統(tǒng)一規(guī)定，但具體內(nèi)容大不相同。銀行承兌匯票上的必須記載事項有“表明銀行承兌匯票的字樣”、無條件支付的委托、確定的金額、付款人名稱、收款人名稱、出票日期、出票人簽章；而信用證上的要素相對較多，除了相應的當事人名稱、賬號、金額等要素外，還有對貨物的詳細描述，以及對賣方提供單據(jù)的具體要求等。
(二)兩者所體現(xiàn)的內(nèi)在結(jié)算方式不同
國內(nèi)信用證體現(xiàn)的是單款對流的方式，銀行承兌匯票體現(xiàn)的是貨款對流的方式。在國內(nèi)信用證項下的商品交易，賣方是憑單交貨，買方是憑單付款。賣方向承運人提供貨物后獲得運輸單據(jù)(憑單交貨)，再將全套單據(jù)(包括代表物權(quán)的單據(jù)如貨物提單、商業(yè)發(fā)票等)交給銀行，由銀行辦理托收(或向銀行辦理議付)，買方向通知行付款贖單(憑單付款)。而銀行承兌匯票項下的商品交易通常采用的是一手交錢，一手交貨的方式即買方向賣方交付票據(jù)(通過背書方式)，賣方驗票后交貨。
(三)兩者對各自項下商品交易的要求和約束不同
雖然申請辦理銀行承兌匯票時，銀行要求申請人提供雙方交易合同，但不能保證申請人在獲得銀行承兌匯票后，真正用這張票去履行該筆合同。通常，銀行在作出承兌后，不再去管匯票的流向和其實際的用途，只是到期負責支付匯票款項。