公司保函的辦理流程如下：

1. 申請(qǐng)人需填寫并提交保函申請(qǐng)書(shū)，以及相關(guān)證明文件和保證金。

2. 銀行收到申請(qǐng)后，會(huì)進(jìn)行保函內(nèi)容和格式的審查。

3. 如果審查通過(guò)，銀行會(huì)根據(jù)申請(qǐng)書(shū)的約定，向受益人開(kāi)出保函。

4. 保函一旦開(kāi)出，銀行將承擔(dān)相應(yīng)的法律責(zé)任，保障申請(qǐng)人的利益。