準備室：用于配制培養(yǎng)基和樣品處理等，室內設有試劑柜、存放器具或材料的專柜、電源、電爐、冰箱、實驗臺和上下水道等。

洗滌室：用于洗刷器皿等，由于使用過的器皿已被微生物污染，有時還會存在病原微生物。因此，在條件允許的情況下，設置洗滌室。室內配置需有加熱器、蒸鍋，瓶刷、肥皂、洗衣粉等。

室：主要用于培養(yǎng)基的和各種器具的，室內應備有烘箱、高壓蒸汽器等設備及設施。

無菌室：用于系統(tǒng)接種、純化菌種等無菌操作。在微生物工作中，菌種的接種移植是一項主要操作，要保證菌種純種，防止雜菌的污染。