先后獲國家科技進步二等獎2項、省部級一等獎4項、何梁何利科學技術與進步獎，談家楨生命科學臨床醫(yī)學獎，轉化醫(yī)學杰出貢獻獎，吳階平醫(yī)藥創(chuàng)新獎，中國工程院光華工程科技獎。北京大學人民醫(yī)院血液科黃曉軍加急住院掛號

北京大學人民醫(yī)院血液科黃曉軍加急住院掛號）兼任亞太血液聯(lián)盟常委會主任、世界華人醫(yī)師協(xié)會第四屆理事會副會長、第四、五屆中國醫(yī)師協(xié)會血液科醫(yī)師分會會長、第九屆中華醫(yī)學會血液學分會主委。

黃曉軍醫(yī)生擅長

血液系統(tǒng)疾病，造血干細胞移植（HSCT）后的移植物抗宿主?。℅VHD）、感染和復發(fā)等各種移植合并癥的診斷和處理

2007年擔任國家杰出青年科學基金項目負責人，創(chuàng)新團隊帶頭人。負責承擔國家自然科學基金國家“863”基金、“985”基金、北京大學211基金、衛(wèi)生部基金、教育部博士點和“新世紀人才”等多項基金。發(fā)表論文100多篇，綜述10多篇，專著10部。1996年被評為碩士研究生導師，1999年獲北京市醫(yī)務工作者，2003年獲北京市五、四青年稱號，被評為博士生導師。2005年被評為教育部“新世紀人才”。在2006年獲中華醫(yī)學科技獎二等獎，2008年衛(wèi)生部吳楊獎獲得者，2008年中國醫(yī)師獎獲得者。