醫(yī)院擁有5位中國工程院院士，1百多名技術三級以上專家，1千多名高職專業(yè)技術人員。醫(yī)院先后獲得省部級以上科技成果獎勵1300余項，其中，國家科技進步一等獎7項，二等獎20項，國家發(fā)明獎2項，軍隊科技進步一等獎21項。 [2]

2017年11月11日下午，復旦大學醫(yī)院管理研究所正式發(fā)布了《2016年度中國醫(yī)院排行榜》和《2016年度中國醫(yī)院?？坡曌u排行榜》，中國人民解放軍總醫(yī)院名列第三。

重點學科

國家重點學科（8個）：老年醫(yī)學、耳鼻咽喉科學 、內(nèi)科學（呼吸系?。⑼饪茖W（）、外科學（骨外科）、內(nèi)科學（腎?。⑼饪茖W（普外）、傳統(tǒng)中醫(yī)學（中西醫(yī)結合老年?。?。

軍隊重點學科（1個）：骨科

北京市重點學科（2個）：內(nèi)科學、外科學

總后“530工程”重點學科（2個）：野戰(zhàn)內(nèi)科學、野戰(zhàn)外科學

碩博士學位

博士學位一級學科（5個）：臨床醫(yī)學、基礎醫(yī)學、口腔醫(yī)學、中西醫(yī)結合、護理學

碩士學位一級學科（8個）：臨床醫(yī)學、基礎醫(yī)學、口腔醫(yī)學、中西醫(yī)結合、公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學、藥學、中醫(yī)學、護理學

博士后流動站（5個）：臨床醫(yī)學、口腔醫(yī)學、中西醫(yī)結合、基礎醫(yī)學、護理學

對外交流

據(jù)醫(yī)院官網(wǎng)2015年12月信息顯示：醫(yī)院與100多個國家和地區(qū)的醫(yī)學院校、醫(yī)療科研單位開展了廣泛的學術交流和技術合作，每年有700多名技術人員出國進修和技術合作，有400多名國外專家來院訪問、講學。先后聘請了150余名國外學者擔任名譽教授和技術顧問。

醫(yī)學院與解放軍第302醫(yī)院、北京軍區(qū)總醫(yī)院、海軍總醫(yī)院、總醫(yī)院、解放軍第306醫(yī)院、解放軍第309醫(yī)院、武警總醫(yī)院、白求恩國際和平醫(yī)院等多家單位組建教學聯(lián)合體，共同承擔研究生教育任務；近年又分別同清華大學、南開大學、北京中醫(yī)藥大學簽訂聯(lián)合辦學協(xié)議，同時還與100多個國家和地區(qū)的醫(yī)學院校、科研機構開展了廣泛的學術和技術交流。

總醫(yī)院每年都要派出10多批次100多名專家，赴老少邊窮地區(qū)巡診義診，贏得了各方贊譽。

2014年國家科學技術獎

國家創(chuàng)新團隊獎：“解放軍總醫(yī)院器官損傷與修復綜合救治創(chuàng)新團隊”（陳香美、付小兵院士牽頭）

國家技術發(fā)明二等獎：“微波消融設備的研發(fā)與臨床應用”項目（內(nèi)科臨床部超聲介入科梁萍教授）

國家科技進步二等獎：“肝膽胰微創(chuàng)外科技術研究及其推廣應用”項目（內(nèi)科臨床部腫瘤外二科劉榮教授申）、“戰(zhàn)創(chuàng)（燒）傷軟組織毀損修復與功能重建系列技術創(chuàng)新與應用”項目（304臨床部整形科柴家科教授）