醫(yī)院技術(shù)力量雄厚。擁有重點學(xué)科兒科學(xué)，國家兒童腫瘤監(jiān)測中心、國家呼吸系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心、國家中西醫(yī)協(xié)同旗艦醫(yī)院試點單位等12個平臺，8個國家臨床重點專科，5個北京市重點實驗室，2個北京市級研究平臺以及16個市級醫(yī)療中心。醫(yī)院設(shè)有疑難罕見病例會診中心和遠程會診中心，兒科疑難重癥疾病的診斷水平居國內(nèi)地位，是中華醫(yī)學(xué)會兒科學(xué)分會、兒外科分會，中國醫(yī)師協(xié)會小兒外科醫(yī)師分會，中華護理學(xué)會兒科專業(yè)委員會主任委員單位。

北京兒童醫(yī)院共有在職職工3210人，其中醫(yī)生968人，護士1325人，醫(yī)技462人。正高級職稱292人，副高級職稱380人，中級職稱692人。醫(yī)院擁有中國現(xiàn)代兒科學(xué)奠基人諸福棠、中國兒童血液腫瘤學(xué)開創(chuàng)者胡亞美、中國小兒外科創(chuàng)始人之一張金哲等國內(nèi)兒科界僅有的三位院士，以及突出貢獻專家、享受政府特殊津貼人員、新世紀百千萬人才工程人選、國家杰出青年科學(xué)基金獲得者等眾多高層次人才。

醫(yī)院擁有教育部兒科學(xué)國家重點學(xué)科和教學(xué)團隊，是首都醫(yī)科大學(xué)兒科醫(yī)學(xué)院和兒科學(xué)系所在地，現(xiàn)有教授、副教授116人，承擔著本科及博士、碩士研究生、七年制兒科專業(yè)，護理大專及繼續(xù)醫(yī)學(xué)教育等多層次教學(xué)任務(wù)，并設(shè)有博士后流動站，每年為社會輸送大量兒科人才。

國家兒童醫(yī)學(xué)中心首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京兒童醫(yī)院白血病專業(yè)在胡亞美院士帶領(lǐng)下，從1976年率先在國內(nèi)開展兒童白血病診治，1998年至今血液專業(yè)被評為北京市重點學(xué)科。目前北京兒童醫(yī)院(北京病區(qū))每年收治兒童和青少年白血病患兒近300例，北京兒童醫(yī)院保定病區(qū)每年收治兒童和青少年白血病患兒近100例。

白血病是起源于骨髓的一種惡性腫瘤，兒童和青少年白血病發(fā)病率為十萬分之四左右，即每年我國新發(fā)1.5-2萬例。隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展，兒童白血病診治水平不斷提高，目前兒童急性淋巴細胞白血病的率已達80%以上、急性髓細胞白血病率達70%以上、急性早幼粒細胞白血病率達95%以上。據(jù)2020年底統(tǒng)計，北京兒童醫(yī)院已白血病患兒3000余人，其中不少孩子已長大成人，進入大學(xué)學(xué)習(xí)和走上工作崗位，并且結(jié)婚生育了100多名健康的小寶寶。

從2008年起，在吳敏媛教授帶領(lǐng)下白血病專業(yè)組牽頭開展了全國兒童白血病多中心診治研究，之后白血病團隊不斷提高全國兒童和青少年白血病診治的同質(zhì)化水平，是國家衛(wèi)生健康委制定白血病臨床路徑和診療規(guī)范的牽頭單位。從2015年起，我們不斷優(yōu)化方案，在經(jīng)典化療的基礎(chǔ)上開展兒童和青少年白血病的靶向和免疫，逐漸減化療和去化療，明顯降低了白血病過程中的毒副作用。在白血病診治過程中同時開展多學(xué)科聯(lián)合診治及人文關(guān)懷，每年舉辦“六一”兒童聯(lián)歡會，使患兒不僅獲得軀體疾病的，更獲得精神心理的康復(fù)，明顯提高了康復(fù)兒童的生存質(zhì)量。2023年7月下旬，白血病科病房由西城本部院區(qū)遷至北京兒童醫(yī)院順義婦兒醫(yī)院院區(qū)，床位由40余張擴大至90張。

白血病專業(yè)組注重臨床科研及轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究，負責國家及省部級科研項目30余項。開展了“兒童和青少年白血病的多學(xué)科綜合”、“白血病基因?qū)W分型和個性化”、“兒童白血病微小殘留病”等多項研究，獲科技成果獎10余項，發(fā)表研究論文200余篇。