北京兒童醫(yī)院共有在職職工3210人，其中醫(yī)生968人，護士1325人，醫(yī)技462人。正高級職稱292人，副高級職稱380人，中級職稱692人。醫(yī)院擁有中國現(xiàn)代兒科學奠基人諸福棠、中國兒童血液腫瘤學開創(chuàng)者胡亞美、中國小兒外科創(chuàng)始人之一張金哲等國內(nèi)兒科界僅有的三位院士，以及突出貢獻專家、享受政府特殊津貼人員、新世紀百千萬人才工程人選、國家杰出青年科學基金獲得者等眾多高層次人才。

北京兒童醫(yī)院積極發(fā)揮學科作用，領(lǐng)航兒科行業(yè)發(fā)展。2013年牽頭組建北京兒童醫(yī)院集團，創(chuàng)新“病人不動、醫(yī)生移動”的模式服務(wù)全國患兒，目前理事單位成員已達57家。醫(yī)院與美國、俄羅斯、加拿大、意大利、澳大利亞、瑞典、德國、法國、日本、新加坡等國家的兒童醫(yī)療機構(gòu)和科研院所建立了良好的關(guān)系和廣泛的合作，是科技部認定的兒童重大疾病國際科技合作基地。

國家兒童醫(yī)學中心首都醫(yī)科大學附屬北京兒童醫(yī)院白血病專業(yè)在胡亞美院士帶領(lǐng)下，從1976年率先在國內(nèi)開展兒童白血病診治，1998年至今血液專業(yè)被評為北京市重點學科。目前北京兒童醫(yī)院(北京病區(qū))每年收治兒童和青少年白血病患兒近300例，北京兒童醫(yī)院保定病區(qū)每年收治兒童和青少年白血病患兒近100例。

白血病是起源于骨髓的一種惡性腫瘤，兒童和青少年白血病發(fā)病率為十萬分之四左右，即每年我國新發(fā)1.5-2萬例。隨著科學技術(shù)的發(fā)展，兒童白血病診治水平不斷提高，目前兒童急性淋巴細胞白血病的率已達80%以上、急性髓細胞白血病率達70%以上、急性早幼粒細胞白血病率達95%以上。據(jù)2020年底統(tǒng)計，北京兒童醫(yī)院已白血病患兒3000余人，其中不少孩子已長大成人，進入大學學習和走上工作崗位，并且結(jié)婚生育了100多名健康的小寶寶。

從2008年起，在吳敏媛教授帶領(lǐng)下白血病專業(yè)組牽頭開展了全國兒童白血病多中心診治研究，之后白血病團隊不斷提高全國兒童和青少年白血病診治的同質(zhì)化水平，是國家衛(wèi)生健康委制定白血病臨床路徑和診療規(guī)范的牽頭單位。從2015年起，我們不斷優(yōu)化方案，在經(jīng)典化療的基礎(chǔ)上開展兒童和青少年白血病的靶向和免疫，逐漸減化療和去化療，明顯降低了白血病過程中的毒副作用。在白血病診治過程中同時開展多學科聯(lián)合診治及人文關(guān)懷，每年舉辦“六一”兒童聯(lián)歡會，使患兒不僅獲得軀體疾病的，更獲得精神心理的康復，明顯提高了康復兒童的生存質(zhì)量。2023年7月下旬，白血病科病房由西城本部院區(qū)遷至北京兒童醫(yī)院順義婦兒醫(yī)院院區(qū)，床位由40余張擴大至90張。

白血病專業(yè)組注重臨床科研及轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究，負責國家及省部級科研項目30余項。開展了“兒童和青少年白血病的多學科綜合”、“白血病基因?qū)W分型和個性化”、“兒童白血病微小殘留病”等多項研究，獲科技成果獎10余項，發(fā)表研究論文200余篇。

2001年，在胡亞美院士和吳敏媛教授的直接領(lǐng)導下，成立北京兒童醫(yī)院血液病中心造血干細胞移植專業(yè)組，是國內(nèi)早系統(tǒng)開展兒童造血干細胞移植工作的中心之一。2021年，在原有血液腫瘤中心干細胞移植病房基礎(chǔ)上，成立了北京兒童醫(yī)院干細胞移植科，同年 6月，干細胞移植科在北京兒童醫(yī)院保定醫(yī)院，成立了我國北方、保定的兒童造血干細胞移植中心，現(xiàn)干細胞移植科分為2個病區(qū)，北京病區(qū)（本部）和保定病區(qū)， 2個病區(qū)共20間百級移植倉，6間千級移植倉，2個干細胞采集室，1個干細胞實驗室，每年進行150-250例造血干細胞移植，是目前我國北方的兒童造血干細胞移植中心，秦茂權(quán)帶領(lǐng)其團隊分別長駐北京和保定同時開展干細胞移植工作，保證及管理的同質(zhì)化。