醫(yī)院技術(shù)力量雄厚。擁有重點學(xué)科兒科學(xué)，國家兒童腫瘤監(jiān)測中心、國家呼吸系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心、國家中西醫(yī)協(xié)同旗艦醫(yī)院試點單位等12個平臺，8個國家臨床重點?？?，5個北京市重點實驗室，2個北京市級研究平臺以及16個市級醫(yī)療中心。醫(yī)院設(shè)有疑難罕見病例會診中心和遠程會診中心，兒科疑難重癥疾病的診斷水平居國內(nèi)地位，是中華醫(yī)學(xué)會兒科學(xué)分會、兒外科分會，中國醫(yī)師協(xié)會小兒外科醫(yī)師分會，中華護理學(xué)會兒科專業(yè)委員會主任委員單位。
北京兒童醫(yī)院血液病科自1995年在胡亞美院士的領(lǐng)導(dǎo)下建立，1998年被評為北京市重點學(xué)科，1999年成立了集臨床、科研、教學(xué)及培訓(xùn)為一體的全國的兒童血液腫瘤中心，2007年被評為兒科學(xué)國家重點學(xué)科，2008年和2012年分別獲批兒科學(xué)教育部重點實驗室和北京市重點實驗室，2014年被評為北京市重點醫(yī)學(xué)專業(yè)(揚帆計劃)。
2023年7月血液病科重新?lián)P帆起航，將病房整體搬遷至北京兒童醫(yī)院順義院區(qū)（原北京市順義婦兒醫(yī)院、順康路1號仁和樓11層），同時在西城、順義兩個院區(qū)設(shè)置專業(yè)門診以利于廣大患兒便捷就醫(yī)（出診信息詳見文末“北京兒童醫(yī)院血液病科”微信公眾號）。
經(jīng)過30多年的不懈努力，血液病科專業(yè)學(xué)術(shù)水平始終處于全國地位，與國際接軌，承擔及省部級重大科研項目10余項，每年在國內(nèi)外期刊發(fā)表相關(guān)論文數(shù)十篇，是國內(nèi)兒童血液病診治研究的牽頭單位。目前的血液病科人員配備更完善，專業(yè)劃分更深入，設(shè)置了四個醫(yī)療專業(yè)組，分別為：出凝血專業(yè)組、組織細胞病專業(yè)組、骨髓衰竭性疾病專業(yè)組、紅細胞及骨髓增殖性疾病專業(yè)組，診療范圍包括血友病、凝血功能異常、血栓性疾病、血小板減少癥、噬血細胞綜合征、朗格罕細胞組織細胞增生癥、慢性活動性EB病毒感染、幼年性黃色肉芽腫、再生障礙性貧血、先天性及獲得性骨髓衰竭性疾病、陣發(fā)性睡眠性血紅蛋白尿、先天性角化不良、舒戴綜合征、缺鐵性貧血、地中海貧血、巨幼細胞性貧血、自身免疫性溶血、骨髓增生異常綜合征、幼年型粒單核細胞白血病、慢性粒單核細胞白血病、Castleman病等多種血液系統(tǒng)常見病及疑難危重癥，設(shè)有床位42張，其中隔離病房2間，專門用于再生障礙性貧血患兒的ATG及嚴重骨髓抑制患兒的診治，每年共收治來自全國各地的血液病患兒超過5000例次。為配合醫(yī)院大規(guī)劃需求，“一院兩區(qū)”促進高質(zhì)量發(fā)展，改善血液病患兒的就醫(yī)情況，搬遷后的順義院區(qū)新病房樓設(shè)施先進，均為可陪住的3人標準間，每個病室都配置衛(wèi)生間和浴室。新病區(qū)按照兒童友好型醫(yī)院理念和標準建設(shè)，病房寬敞明亮，室內(nèi)設(shè)有圖書館、兒童活動區(qū)，室外設(shè)有兒童樂園，住院環(huán)境顯著提高，是一所名副其實的“樂園式醫(yī)院”。
血液病科醫(yī)療團隊人員配備合理，診療技術(shù)精湛，在學(xué)科帶頭人的領(lǐng)導(dǎo)下，各學(xué)科分工合作，積極進取，中青年骨干嶄露頭角，后備力量強勁?？剖夜灿胁┦垦芯可鷮?dǎo)師3名，包括現(xiàn)任中華醫(yī)學(xué)會兒科分會主任委員、中華醫(yī)學(xué)會理事、中國醫(yī)師協(xié)會兒科分會副會長王天有教授，國家衛(wèi)生健康委員會兒童血液病專家委員會副主任委員、中國罕見病聯(lián)盟血友病學(xué)組副主任委員、中華血液學(xué)會血栓與止血學(xué)組成員吳潤暉教授，全國兒童EBV感染協(xié)作組副組長、中華醫(yī)學(xué)會兒科分會血液學(xué)組秘書、中國醫(yī)師協(xié)會血液科醫(yī)師分會組織細胞疾病專業(yè)委員會委張蕊教授。血液病科專業(yè)技術(shù)團隊目前共有醫(yī)師25名，其中主任醫(yī)師7名，副主任醫(yī)師 2名，主治醫(yī)師9名，博士學(xué)位16人。
血液病科除擁有實力雄厚的醫(yī)療團隊外，還擁有專業(yè)的護理團隊，目前共有專職護士27人，其中主管護師5人，護師22人，共有5名?？谱o士，其中靜療?？谱o士2人，血液?？谱o士2人，腫瘤專科護士1人。血液病科的護士有著豐富的兒科臨床護理經(jīng)驗，業(yè)務(wù)精良，技術(shù)精湛，特別是在各類血液疾病的用藥護理，患兒的皮膚及各類造口護理，飲食護理，疾病的居家護理以及PICC、輸液港的維護等方面專業(yè)技術(shù)突出。
血液病科謹遵“公慈勤和”的院訓(xùn)，發(fā)揚“明德 仁愛 傳承 創(chuàng)新”的科訓(xùn)精神，秉承敬佑生命、救死扶傷、甘于奉獻、大愛無疆的醫(yī)者仁心，結(jié)合兒科病人的特點，在診療疾病的同時也注重患兒的生存質(zhì)量、營養(yǎng)管理、生長發(fā)育以及人文關(guān)懷。攜手醫(yī)務(wù)社工團隊共同開展心理疏導(dǎo)，在“六一”兒童節(jié)、中秋節(jié)、春節(jié)等節(jié)假日舉行兒童畫展并為患兒發(fā)放愛心小禮物，同時創(chuàng)辦“北京兒童醫(yī)院血液病科”微信公眾號，以便加強醫(yī)患雙方溝通，進一步提高就醫(yī)體驗。血液病科全體醫(yī)護人員希望通過我們的專業(yè)知識、專業(yè)技能及優(yōu)質(zhì)的護理服務(wù)，幫助到每一位患兒及家長朋友們!
腫瘤內(nèi)科科室包括兒童實體腫瘤、兒童淋巴瘤兩個專業(yè)，住院部設(shè)置在北京兒童醫(yī)院順義院區(qū)，擁有兩個病區(qū)，分別收治兒童實體瘤、淋巴瘤病人。腫瘤內(nèi)科在北京兒童醫(yī)院西城院區(qū)、順義院區(qū)，均設(shè)置有專業(yè)門診，均由專業(yè)醫(yī)生團隊出診，患者可根據(jù)需求選擇不同院區(qū)就診。
2001年，在胡亞美院士和吳敏媛教授的直接領(lǐng)導(dǎo)下，成立北京兒童醫(yī)院血液病中心造血干細胞移植專業(yè)組，是國內(nèi)早系統(tǒng)開展兒童造血干細胞移植工作的中心之一。2021年，在原有血液腫瘤中心干細胞移植病房基礎(chǔ)上，成立了北京兒童醫(yī)院干細胞移植科，同年 6月，干細胞移植科在北京兒童醫(yī)院保定醫(yī)院，成立了我國北方、保定的兒童造血干細胞移植中心，現(xiàn)干細胞移植科分為2個病區(qū)，北京病區(qū)（本部）和保定病區(qū)， 2個病區(qū)共20間百級移植倉，6間千級移植倉，2個干細胞采集室，1個干細胞實驗室，每年進行150-250例造血干細胞移植，是目前我國北方的兒童造血干細胞移植中心，秦茂權(quán)帶領(lǐng)其團隊分別長駐北京和保定同時開展干細胞移植工作，保證及管理的同質(zhì)化。