醫(yī)院以病人為中心，全心全意為兒童服務(wù)，大力弘揚(yáng)“公慈勤和”院訓(xùn)精神，涌現(xiàn)出全國(guó)道德模范、全國(guó)共產(chǎn)黨員賈立群同志等杰出代表。醫(yī)院堅(jiān)持公益，始終“關(guān)注兒童、關(guān)注健康”，成立“北京兒童健康基金會(huì)”，扶助困難家庭患兒就醫(yī);組織醫(yī)療骨干參加援疆援藏任務(wù)、“人才京郊行”、大型義診活動(dòng)，為偏遠(yuǎn)地區(qū)和基層單位的兒童送醫(yī)、送藥、送健康;開(kāi)展免費(fèi)救治西藏先心病、唇腭裂患兒活動(dòng)，舉辦血友病、糖尿病、白血病兒童夏令營(yíng)，讓患兒感受到社會(huì)的溫暖。

重點(diǎn)學(xué)科：

兒科學(xué)

● 國(guó)家臨床重點(diǎn)專科：

兒童重癥、小兒呼吸、中西醫(yī)結(jié)合兒科、小兒外科、臨床護(hù)理、兒童血液病、兒童腫瘤、耳鼻咽喉頭頸外科

● 平臺(tái)：

國(guó)家兒童醫(yī)學(xué)中心

國(guó)家兒童腫瘤監(jiān)測(cè)中心

國(guó)家兒童呼吸系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心

教育部?jī)嚎浦卮蠹膊⊙芯恐攸c(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

科技部?jī)和卮蠹膊?guó)際科技合作基地

科技部?jī)和】蛋l(fā)展國(guó)際聯(lián)合研究中心

科技部創(chuàng)新人才培養(yǎng)示范基地

國(guó)家疑難病癥診治能力提升工程項(xiàng)目?jī)?chǔ)備庫(kù)

國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理總局臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)

兒童白血病的國(guó)際化新藥臨床評(píng)價(jià)研究技術(shù)平臺(tái)

兒童示范性新藥臨床評(píng)價(jià)技術(shù)平臺(tái)

國(guó)家中西醫(yī)協(xié)同旗艦醫(yī)院試點(diǎn)單位

2001年，在胡亞美院士和吳敏媛教授的直接領(lǐng)導(dǎo)下，成立北京兒童醫(yī)院血液病中心造血干細(xì)胞移植專業(yè)組，是國(guó)內(nèi)早系統(tǒng)開(kāi)展兒童造血干細(xì)胞移植工作的中心之一。2021年，在原有血液腫瘤中心干細(xì)胞移植病房基礎(chǔ)上，成立了北京兒童醫(yī)院干細(xì)胞移植科，同年 6月，干細(xì)胞移植科在北京兒童醫(yī)院保定醫(yī)院，成立了我國(guó)北方、保定的兒童造血干細(xì)胞移植中心，現(xiàn)干細(xì)胞移植科分為2個(gè)病區(qū)，北京病區(qū)（本部）和保定病區(qū)， 2個(gè)病區(qū)共20間百級(jí)移植倉(cāng)，6間千級(jí)移植倉(cāng)，2個(gè)干細(xì)胞采集室，1個(gè)干細(xì)胞實(shí)驗(yàn)室，每年進(jìn)行150-250例造血干細(xì)胞移植，是目前我國(guó)北方的兒童造血干細(xì)胞移植中心，秦茂權(quán)帶領(lǐng)其團(tuán)隊(duì)分別長(zhǎng)駐北京和保定同時(shí)開(kāi)展干細(xì)胞移植工作，保證及管理的同質(zhì)化。

北京兒童醫(yī)院眼科為擁有專業(yè)門診、病房、醫(yī)技檢查、驗(yàn)光配鏡中心、弱視訓(xùn)練、視感知覺(jué)工作室為一體的綜合性兒童眼病診療中心，同時(shí)為北京市殘聯(lián)指定殘疾評(píng)估、康復(fù)中心，并托管北京兒童醫(yī)院保定醫(yī)院、北京市順義區(qū)婦幼保健院、北京兒童醫(yī)院鄭州醫(yī)院、北京兒童醫(yī)院新疆醫(yī)院、北京兒童醫(yī)院黑龍江醫(yī)院。