十余年來，北醫(yī)三院門、急診量始終居北京市各大醫(yī)院前列。2018年，年服務門診患者403萬余人次，急診患者近27萬人次，出院患者逾11萬人次，完成手術6.3萬例次。平均住院日為5.51天/人次。在北京市DRGs（疾病診斷相關組）綜合評價中，北醫(yī)三院各項主要管理指標達先進水平。在北醫(yī)三院住院患者中，三分之一以上是來自全國各地的疑難雜癥患者。

北醫(yī)三院為完成單位，喬杰院士團隊牽頭的“配子胚胎發(fā)育研究與生育力改善新方法的應用”研究榮獲2017年國家科技進步獎二等獎，“生殖細胞發(fā)育的表觀遺傳調控機制及體外干預方法研究”項目，榮獲2018年中華醫(yī)學科技一等獎；骨科劉忠軍教授團隊牽頭的“3D打印鈦合金骨科植入物的臨床應用與關鍵技術研究”榮獲2018年北京市科學技術獎一等獎。

北醫(yī)三院以強烈的社會責任感積極投身公立醫(yī)院改革。近年來不斷提高管理水平，參與多個重大項目和課題的研究，取得成果被政府相關管理部門所采納。在臨床路徑、優(yōu)質服務護理工程、對口支援、醫(yī)聯(lián)體建設、援藏援疆支邊等方面發(fā)揮了醫(yī)院的作用。同時，醫(yī)院還承擔著國家重大活動的醫(yī)療保障工作，承擔著重大突發(fā)事件的醫(yī)療救援任務。近年來，出色完成了北京奧運會、建國六十典、抗震救災、健康快車、埃博拉出血熱病人救援、非洲“光明行”、歷次全國“兩會”等各項醫(yī)療保障任務。

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