北醫(yī)三院擁有3個教育部創(chuàng)新團隊：骨科、運動醫(yī)學研究所、婦產科；3個教育部重點實驗室：輔助生殖、分子心血管學（參與）和視覺損傷與修復（參與）；1個國家衛(wèi)生健康委重點實驗室：心血管分子生物學與調節(jié)肽；8個北京市重點實驗室：磁共振成像設備與技術、脊柱疾病研究、生殖內分泌與輔助生殖技術、心血管受體研究、運動醫(yī)學關節(jié)傷病、幽門螺桿菌感染與上胃腸疾病、眼部神經損傷重建保護與康復、神經退行性疾病生物標志物研究及轉化。

北醫(yī)三院為完成單位，喬杰院士團隊牽頭的“配子胚胎發(fā)育研究與生育力改善新方法的應用”研究榮獲2017年國家科技進步獎二等獎，“生殖細胞發(fā)育的表觀遺傳調控機制及體外干預方法研究”項目，榮獲2018年中華醫(yī)學科技一等獎；骨科劉忠軍教授團隊牽頭的“3D打印鈦合金骨科植入物的臨床應用與關鍵技術研究”榮獲2018年北京市科學技術獎一等獎。

醫(yī)院連續(xù)多年榮獲多項榮譽。榮獲全國文明單位、全國衛(wèi)生文化建設先進單位、全國醫(yī)藥衛(wèi)生系統(tǒng)先進集體、全國醫(yī)藥衛(wèi)生系統(tǒng)創(chuàng)先爭優(yōu)活動先進集體、全國綜合醫(yī)院中醫(yī)藥工作示范單位、首都十大疾病科技攻關與管理工作核心單位等，神經內科、心血管內科、眼科、運動醫(yī)學研究所、藥劑科等榮獲“全國青年文明號”榮譽稱號，醫(yī)院被中華全國總工會授予“模范職工之家”稱號。 [2]

早的胃鏡是德國人庫斯莫爾在1868年借鑒江湖吞劍術發(fā)明的庫斯莫爾管，它其實就是一根長金屬管，末端裝有鏡子。但因為這種胃鏡容易戳破病人食道，因此不久就廢棄了。1950年，日本醫(yī)生宇治達郎成功發(fā)明軟式胃鏡的雛形——胃內照相機 [2]。臨床上的胃鏡是膠囊內鏡。