醫(yī)院連續(xù)多年榮獲多項(xiàng)榮譽(yù)。榮獲全國文明單位、全國衛(wèi)生文化建設(shè)先進(jìn)單位、全國醫(yī)藥衛(wèi)生系統(tǒng)先進(jìn)集體、全國醫(yī)藥衛(wèi)生系統(tǒng)創(chuàng)先爭(zhēng)優(yōu)活動(dòng)先進(jìn)集體、全國綜合醫(yī)院中醫(yī)藥工作示范單位、首都十大疾病科技攻關(guān)與管理工作核心單位等，神經(jīng)內(nèi)科、心血管內(nèi)科、眼科、運(yùn)動(dòng)醫(yī)學(xué)研究所、藥劑科等榮獲“全國青年文明號(hào)”榮譽(yù)稱號(hào)，醫(yī)院被中華全國總工會(huì)授予“模范職工之家”稱號(hào)。 [2]

2018年，北醫(yī)三院迎來六十華誕，金秋十月，中國醫(yī)院創(chuàng)新發(fā)展峰會(huì)暨北醫(yī)三院建院60周年學(xué)術(shù)研討會(huì)在北京國際會(huì)議中心召開。大會(huì)以“創(chuàng)新點(diǎn)亮未來”為主題與國內(nèi)外同行共同探索新時(shí)代大型醫(yī)院創(chuàng)新發(fā)展之路，引起國內(nèi)同行的廣泛關(guān)注。擁有60年歷史的北醫(yī)三院，積淀歷久彌新的醫(yī)院文化，充滿朝氣與活力。全體北醫(yī)三院人將繼續(xù)秉承“團(tuán)結(jié)、奉獻(xiàn)、求實(shí)、創(chuàng)新”的院訓(xùn)精神，以精湛的醫(yī)術(shù)和高度的責(zé)任感承載生命的重托，為建設(shè)“醫(yī)療中心、高水平的疑難重癥診治中心、臨床醫(yī)學(xué)研究中心和醫(yī)學(xué)人才培養(yǎng)基地”而努力奮斗！

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