百余年來，北大醫(yī)院擁有著一批國內(nèi)的首創(chuàng)專業(yè)學(xué)科以及在我國率先開展的診療技術(shù)，如國內(nèi)首創(chuàng)兒科教研室（1929年）、泌尿外科（1946年）、腎臟病專業(yè)(1950年)、綜合醫(yī)院心血管病房（50年代）、小兒外科（1950年）、兒科神經(jīng)專業(yè)（1961年）；建立全國早的麻醉科實(shí)驗(yàn)室（1961年）、個(gè)臨床藥理研究所（1980年）；在國內(nèi)率先開展改進(jìn)靜脈麻醉（1951年）、宮頸癌根治術(shù)（1951年）、先心手術(shù)（50年代）、分娩鎮(zhèn)痛（1955年）、腎移植手術(shù)（1960年）、人工晶體植入術(shù)（1983）、冠心病介入性（1986年）、胸腔鏡手術(shù)（1992年）、泌尿外科腹腔鏡手術(shù)（1992年）、微創(chuàng)切口肺移植（2005年）、經(jīng)皮心室重建術(shù)（2013年）等；研制我國臺(tái)體外沖擊波碎石機(jī)（1984年）、臺(tái)自體血液回收機(jī)（1990年）等，為我國的醫(yī)學(xué)事業(yè)作出了的貢獻(xiàn)。

北大醫(yī)院學(xué)科齊全，綜合實(shí)力居于國內(nèi)前列、國際一 流，臨床醫(yī)學(xué)一級學(xué)科整體進(jìn)入國家雙建設(shè)學(xué)科范圍?，F(xiàn)有4個(gè)教育部重點(diǎn)學(xué)科（牽頭），1個(gè)國家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)學(xué)科（牽頭），3個(gè)北京市重點(diǎn)學(xué)科（牽頭），7個(gè)教育部重點(diǎn)學(xué)科（參與）；獲批國家臨床重點(diǎn)?？平ㄔO(shè)項(xiàng)目29次，覆蓋25個(gè)學(xué)科。

2022年度中國醫(yī)院聲譽(yù)排行榜中，1個(gè)學(xué)科位列全國第 一，5個(gè)學(xué)科排名前五、9個(gè)學(xué)科排名前十。在領(lǐng)軍人才建設(shè)方面，擁有中國工程院院士1人、國家自然科學(xué)基金創(chuàng)新群體1人、萬人計(jì)劃領(lǐng)軍人才/團(tuán)隊(duì)6人、國家自然科學(xué)基金杰出青年基金獲得者10人、長江學(xué)者特聘/特崗教授5人、教育部創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)2人、科技部領(lǐng)軍人才/團(tuán)隊(duì)6人，其他國 家級高層次人才13人、北京市高層次人才31人。

北大醫(yī)院堅(jiān)持科技是第 一生產(chǎn)力，創(chuàng)新是第 一動(dòng)力，以新質(zhì)生產(chǎn)力引領(lǐng)高質(zhì)量發(fā)展。現(xiàn)有國家皮膚與免疫疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心1個(gè)，國家衛(wèi)生健康委重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1個(gè)，教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1個(gè)，國家藥監(jiān)局重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1個(gè)，北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室5個(gè)。是國家臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)、國家醫(yī)療器械臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)和第 一批北京市研究型病房示范建設(shè)項(xiàng)目單位，擁有臨床試驗(yàn)專業(yè)34個(gè)，醫(yī)療器械臨床試驗(yàn)專業(yè)26個(gè)。