在醫(yī)療實(shí)踐的同時(shí)，曾學(xué)軍教授致力于臨床醫(yī)學(xué)教育，任美國(guó)內(nèi)科醫(yī)師學(xué)會(huì)（ACP）Fellow、美國(guó)醫(yī)學(xué)研究所（IOM）中國(guó)醫(yī)學(xué)教育代表。曾榮獲北京市高等教育改革二等獎(jiǎng)、 “住院醫(yī)師心中好老師”、北京市師德先進(jìn)個(gè)人、北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院教學(xué)名師等榮譽(yù)，帶領(lǐng)普通內(nèi)科獲得2015年北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院教學(xué)團(tuán)隊(duì)稱號(hào)。2019年2月入選十大社區(qū)健康促進(jìn)首 席專家。

北京協(xié)和醫(yī)院風(fēng)濕免疫科科室承擔(dān)或參與完成了數(shù)十項(xiàng)國(guó)家和部委的科研課題，主持和參與眾多國(guó)際、國(guó)內(nèi)多中心臨床研究以及高質(zhì)量單中心臨床研究，發(fā)表數(shù)百篇SCI收錄論文，主持制定多項(xiàng)風(fēng)濕免疫病領(lǐng)域臨床診斷和指南，先后獲得12項(xiàng)國(guó)家及省部級(jí)獎(jiǎng)勵(lì)，包括3項(xiàng)國(guó)家科技進(jìn)步獎(jiǎng)，出版學(xué)術(shù)專著多部。為開展具有管理科學(xué)、規(guī)范的、符合國(guó)際一 流水平的全國(guó)大規(guī)模多中心自身免疫病臨床研究奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。

北京協(xié)和醫(yī)院風(fēng)濕免疫科從建科時(shí)僅有3張病床的小科室發(fā)展到今天，協(xié)和風(fēng)濕免疫科已擁有68張病床，年收治患者1500例次以上，年門診量逾12萬(wàn)人次，不僅注重系統(tǒng)性紅斑狼瘡、干燥綜合征、類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎、強(qiáng)直性脊柱炎等常見風(fēng)濕性疾病的規(guī)范診治，更強(qiáng)調(diào)對(duì)少見風(fēng)濕性疾病、風(fēng)濕性疾病重要臟器損害以及風(fēng)濕性疾病嚴(yán)重并發(fā)癥的綜合診治，追求更精 確的診斷、更細(xì)致的評(píng)估、更有效的治 療效果。

重視科研是協(xié)和風(fēng)濕免疫科的傳統(tǒng)?？剖?979年起就率先在全國(guó)進(jìn)行自身抗體檢測(cè)的研究。1988年，“抗核抗體譜的建立及臨床應(yīng)用研究”獲國(guó)家科技進(jìn)步三等獎(jiǎng)；1995年，“原發(fā)性干燥綜合征的系列研究”獲國(guó)家科技進(jìn)步三等獎(jiǎng)；近年來(lái)，獲北京市科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)、中華醫(yī)學(xué)科技獎(jiǎng)、華夏醫(yī)學(xué)科技獎(jiǎng)等省部級(jí)獎(jiǎng)項(xiàng)共計(jì)13項(xiàng)。