北京301醫(yī)院擁有1個(gè)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、2個(gè)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、9個(gè)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，12個(gè)全軍醫(yī)學(xué)專業(yè)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，國(guó)家臨床醫(yī)學(xué)研究中心1個(gè)，國(guó)際聯(lián)合研究中心1個(gè)，形成了以綜合診療為特色的13項(xiàng)專業(yè)優(yōu)勢(shì)。

北京301醫(yī)院先后獲得省部級(jí)以上科技成果獎(jiǎng)勵(lì)1300余項(xiàng)，其中，國(guó)家科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)7項(xiàng)，二等獎(jiǎng)22項(xiàng)，國(guó)家發(fā)明獎(jiǎng)3項(xiàng)，軍隊(duì)科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)21項(xiàng)。醫(yī)院承擔(dān)“973”、“863”等各類課題800多項(xiàng)，在中國(guó)國(guó)內(nèi)、國(guó)際公開發(fā)表的論文總數(shù)和國(guó)內(nèi)論文被引用次數(shù)連續(xù)4年居全國(guó)醫(yī)院之首。

令狐恩強(qiáng)率先定名完善消化內(nèi)鏡隧道技術(shù)，模糊了消化內(nèi)外科的界限，替代了一批傳統(tǒng)外科手術(shù)；率先提出基于保持人體解剖結(jié)構(gòu)不變條件下，達(dá)到祛除疾病目的的超級(jí)微創(chuàng)手術(shù)新概念，替代長(zhǎng)期存在以切除器官為代價(jià)的手術(shù)模式，為未來手術(shù)方法學(xué)與器械研發(fā)指明了方向。

令狐恩強(qiáng)說，在2010年前后，我國(guó)提出消化內(nèi)鏡診治新模式的概念，來踐行早診早治的理念。一方面是把檢查切入點(diǎn)從有癥狀期提前到無癥狀期，另一方面則是形成以消化內(nèi)鏡治 療為主，外科手術(shù)切除為輔，放化療為補(bǔ)充的一套全新的治 療概念。該理念保證了患者能在早期就能被發(fā)現(xiàn)，并進(jìn)行有效的內(nèi)鏡下治 療，具有良好的社會(huì)意義和經(jīng)濟(jì)效益。