北京301醫(yī)院擁有5位中國工程院院士，1百多名技術(shù)三級以上專家，1千多名高職專業(yè)技術(shù)人員。醫(yī)院先后獲得省部級以上科技成果獎勵1300余項，其中，國家科技進步一等獎7項，二等獎20項，國家發(fā)明獎2項，軍隊科技進步一等獎21項。

北京301醫(yī)院與100多個國家和地區(qū)的醫(yī)學院校、醫(yī)療科研單位開展了廣泛的學術(shù)交流和技術(shù)合作，每年有700多名技術(shù)人員出國進修和技術(shù)合作，有400多名國外專家來院訪問、講學。先后聘請了150余名國外學者擔任名譽教授和技術(shù)顧問。

令狐恩強率先定名完善消化內(nèi)鏡隧道技術(shù)，模糊了消化內(nèi)外科的界限，替代了一批傳統(tǒng)外科手術(shù)；率先提出基于保持人體解剖結(jié)構(gòu)不變條件下，達到祛除疾病目的的超級微創(chuàng)手術(shù)新概念，替代長期存在以切除器官為代價的手術(shù)模式，為未來手術(shù)方法學與器械研發(fā)指明了方向。

令狐恩強為中國逆行胰膽管造影（ERCP）規(guī)范的出臺做出了積極的貢獻，為中國消化道早癌的內(nèi)鏡下技術(shù)的完善與普及做了大量工作，為中國的內(nèi)鏡下早癌切除躋身世界先進行列做出了積極的貢獻。