根據(jù)《招標(biāo)投標(biāo)法》相關(guān)規(guī)定，雖然承包人應(yīng)發(fā)包人要求提交履約保函是應(yīng)該的，但是承包人可以在保函形式和內(nèi)容方面與發(fā)包人進(jìn)行協(xié)商，增加索賠難度，制約發(fā)包人惡意索賠。承包人可以選擇有條件保函以保障自己的權(quán)益，且將條件明確約定在保函條款中。如果發(fā)包人堅持讓承包人提供無條件保函形式，則可以要求發(fā)包人拿出合法依據(jù)或者要求發(fā)包人提供支付工程款擔(dān)保。

承包人接收到保函索賠通知后，應(yīng)冷靜分析索賠原因，及時選擇合法途徑解決履約保函爭議。首先，應(yīng)與保函當(dāng)事人進(jìn)行溝通。與發(fā)包人溝通，力爭消除雙方誤解，促使發(fā)包人撤回索賠文件或者放棄索賠權(quán)利。與擔(dān)保人溝通，要求擔(dān)保人嚴(yán)格審查索賠文件，合理謹(jǐn)慎地履行賠償義務(wù)。其次，以發(fā)包人為被告提起訴訟，并申請訴前或訴訟財產(chǎn)保全措施，請求法院裁定通知擔(dān)保人暫停保函項下賠付，待基礎(chǔ)合同糾紛解決后，視生效判決或裁定結(jié)果決定終是否賠付，以避免給擔(dān)保人或者承包人造成無法挽回的經(jīng)濟(jì)損失。但由于我國現(xiàn)有法律并沒規(guī)定保函欺詐或不當(dāng)索賠例外的規(guī)則，承包人只能依據(jù)民事訴訟法的相關(guān)規(guī)定提出上述請求，實踐中法院是否作出上述裁定，有待其具體裁量。

履約保證金必須游離在工程造價之外，只作為中標(biāo)方違約時招標(biāo)方損失的補(bǔ)償，招標(biāo)人必須是具備招標(biāo)能力的法人，其建設(shè)資金已經(jīng)到位，不能把履約保證金作為工程造價的補(bǔ)充。因此，履約保證金具有獨立性，必須由雙方認(rèn)可的機(jī)構(gòu)負(fù)責(zé)收繳、儲存、執(zhí)行和返還。

預(yù)付保函又稱還款保函及退款保函，在貿(mào)易合同中還可以成為定金保函。在大額交易中，買方或業(yè)主在合約簽訂后的一定時間內(nèi)預(yù)先需向供貨方支付一定比例的款項作為執(zhí)行合同的啟動資金，由于該款項是對供貨方在履約之前所作的預(yù)付，買方為了避免日后由于供貨方拒絕履行義務(wù)或者無法履行義務(wù)，卻不退款而無端遭到損失，通常要求供貨方在買方預(yù)付之前的若干日內(nèi)通過其銀行開出預(yù)付保函，有銀行作出承諾，一旦申請人未能履約或者是無法全部履約(不管這種行為是有意的或者是無意造成的)，擔(dān)保行將在收到買方提出的索賠后，向其返還這筆與預(yù)付金額等值的款項，或者相當(dāng)于合約尚未履行部分相當(dāng)比例的預(yù)付金額，使買方能夠順利的收回所預(yù)付的款項。