北中醫(yī)三院目前編制床位520張，有34個臨床科室，5個醫(yī)技科室，4個門診部，3個社區(qū)衛(wèi)生服務站;醫(yī)院有正高職稱專家62名，副高職稱專家113名，具有博士學位人員161名，碩士學位人員204名。醫(yī)院有北京中醫(yī)藥大學經方現代臨床應用研究所、北京中醫(yī)藥大學骨傷科研究所。

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北中醫(yī)三院擁有磁共振成像系統(tǒng)、瑞典醫(yī)科達Precise直線加速器、德國Siemens數字減影血管成像系統(tǒng)（DSA）、消化內鏡診療系統(tǒng)等大型進口診療設備，為醫(yī)院的急危重癥救治提供了完善的技術保障。