北京兒童醫(yī)院設(shè)備先進(jìn)、設(shè)施完善、技術(shù)力量雄厚，科室齊全，設(shè)有呼吸科、泌尿外科、重癥醫(yī)學(xué)科、血液腫瘤中心等35個(gè)臨床和醫(yī)技科室。醫(yī)院擁有國家呼吸系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心，兒科重癥、小兒呼吸、中西醫(yī)結(jié)合兒科、小兒外科和臨床護(hù)理等5個(gè)國家臨床重點(diǎn)?？平ㄔO(shè)項(xiàng)目，還擁有兒童白血病分子分型、小兒耳鼻咽喉頭頸外科、兒科呼吸感染等3個(gè)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，北京市兒童外科矯形支具工程技術(shù)研究中心以及小兒先天性心臟病中心、小兒實(shí)體瘤中心、兒童睡眠疾病中心等1 6個(gè)市級(jí)醫(yī)療中心。在小兒復(fù)雜先心病的手術(shù)、各類脊柱畸形的矯正、小兒泌尿畸形矯正、腹胸腔鏡、急腹癥及創(chuàng)傷以及

神經(jīng)、呼吸、內(nèi)分泌、腎病、血液透析、耳鼻喉、纖維支氣管鏡、影像技術(shù)等專業(yè)疾病的診斷及診療設(shè)備居國內(nèi)地位，并率先在國內(nèi)將兒科就診年齡擴(kuò)大到18歲。

北京兒童醫(yī)院共有在職職工2105人，其中醫(yī)生597人，護(hù)士927人，醫(yī)技279人。正高級(jí)職稱138人，副高級(jí)職稱168人，中級(jí)職稱570人。醫(yī)院擁有中國現(xiàn)代兒科醫(yī)學(xué)奠基人諸福棠、小兒白血病專業(yè)學(xué)科帶頭人胡亞美、中國小兒外科創(chuàng)始人之一張金哲等國內(nèi)兒科界僅有的三位院士，以及突出貢獻(xiàn)專家9人，享受政府特殊津貼人員31人，先后有38人次入選“十百千”人才資助。

多年來，為方便病人，北京兒童醫(yī)院始終堅(jiān)持24小時(shí)接診病人，同時(shí)開設(shè)晚間門診。為繼續(xù)深入推動(dòng)公立醫(yī)院醫(yī)療改革，醫(yī)院積極推進(jìn)預(yù)約掛號(hào)工作，優(yōu)化服務(wù)流程，有針對(duì)性地解決了群眾反映突出的“看病難、住院難”問題，受到國家衛(wèi)計(jì)委的肯定和廣大群眾的認(rèn)可。在完成日常醫(yī)療工作的同時(shí)，醫(yī)院還承擔(dān)了國家衛(wèi)計(jì)委、北京市衛(wèi)生局委派的手足口病防治、問題奶粉篩查、H7N9禽流感疫情篩查、抗震救災(zāi)支援、突發(fā)公共事件救援等醫(yī)療救治任務(wù)。多年來，醫(yī)院以”以病人為中心，全心全意為兒童服務(wù)”為宗旨，大力弘揚(yáng)“公慈勤和”院訓(xùn)精神，樹立醫(yī)德醫(yī)風(fēng)品牌，涌現(xiàn)出全國道德模范、“時(shí)代楷?！辟Z立群同志等杰出代表。

積極開展科研指導(dǎo)臨床是小兒泌尿外科的另一特色。尿道下裂病因?qū)W研究、包皮血液供應(yīng)的解剖學(xué)研究、尿道下裂修復(fù)手術(shù)的臨床研究、腎腫瘤病理組織類型、橫紋肌肉瘤多藥耐藥性的研究、神經(jīng)源性膀胱等下尿路梗阻尿動(dòng)力學(xué)研究等對(duì)推動(dòng)上述臨床工作發(fā)展和水平提高發(fā)揮了重要作用。