主要研究方向為兒童糖尿病領(lǐng)域，涵蓋兒童糖尿病流行病學(xué)研究、生存、代謝控制狀況及胰島素抵抗相關(guān)疾病范化研究。先天性高胰島素性/新生兒糖尿病臨床與遺傳學(xué)研究。性腺研究主要包括嬰幼兒乳房發(fā)育臨床監(jiān)測、DSD病因?qū)W及Kallmann綜合征的基因?qū)W研究、小陰莖的、AAA綜合征的遺傳學(xué)研究、DSD患者體格發(fā)育研究、Silver Russule 綜合征遺傳學(xué)研究等。同時承擔(dān)研究生教學(xué)以及留學(xué)生英文教學(xué)。

鞏純秀學(xué)術(shù)兼職中華醫(yī)學(xué)會兒科內(nèi)分泌遺傳代謝學(xué)組副組長，中華醫(yī)學(xué)會糖尿病學(xué)會委員，中華醫(yī)學(xué)會糖尿病學(xué)會1型糖尿病學(xué)組副組長，北京醫(yī)學(xué)會兒科分會內(nèi)分泌遺傳代謝學(xué)組組長，中華醫(yī)學(xué)會糖尿病學(xué)分會北京分會委員，原亞太兒科內(nèi)分泌學(xué)會理事會理事，中國醫(yī)師協(xié)會內(nèi)分泌代謝學(xué)分會常委。中華兒科雜志編委,中華醫(yī)藥雜志常務(wù)編委，中華糖尿病雜志編委，中國糖尿病雜志編委，中國實用兒科雜志編委，中國小兒急救醫(yī)學(xué)編委，免疫分析與臨床雜志編委，柳葉刀糖尿病內(nèi)分泌中文版編委。

兒童內(nèi)分泌科檢查項目包括：血糖、血脂、甲狀腺功能五項、生長、性檢查、甲狀旁腺和嘌呤檢查以及電解質(zhì)檢查等。不同的疾病，需要檢測的項目也有不同。具體檢查什么項目，需要內(nèi)分泌科醫(yī)生根據(jù)臨床癥狀進(jìn)行判斷。

多年來，為方便患者就醫(yī)，醫(yī)院始終堅持24小時接診。北京兒童醫(yī)院積極踐行公立醫(yī)院改革，推進(jìn)預(yù)約掛號工作，優(yōu)化服務(wù)流程，改善患者就醫(yī)體驗，受到國家衛(wèi)生健康委的肯定和廣大群眾的認(rèn)可。醫(yī)院還承擔(dān)了上級部門委派的重大兒童傳染病防治、抗震救災(zāi)支援、突發(fā)公共衛(wèi)生事件救治等醫(yī)療任務(wù)。