清掏周期為3～12個月，實(shí)際設(shè)計(jì)中多取3～9個月，而酸性發(fā)酵階段的酸性發(fā)酵期為3個月，酸性減退期為5個月左右。實(shí)踐證明：清掏周期的取定，應(yīng)兼顧污水處理效果、建設(shè)造價、管理三個方面因素清掏周期一般不宜少于12 個月。
化糞池的清掏周期與糞便污水溫度、氣溫、建筑物性質(zhì)及排水水質(zhì)、水量有關(guān)。設(shè)計(jì)清掏周 期過短，則化糞池糞液濃度過高，與實(shí)際清掏周期差距過大，影響正常發(fā)酵和污水處理效果，甚至造成糞液漫溢，影響環(huán)境衛(wèi)生。設(shè)計(jì)清掏周期過長，則化糞池容積過大，增加造價。
第二池的糞皮和糞渣的數(shù)量減少，因此發(fā)酵分解的程度較低，由于沒有新糞便的進(jìn)入，糞液處于比較靜止?fàn)顟B(tài)，這有利于漂浮在糞池中的蟲卵繼續(xù)下沉。第三池：主要起儲存糞液的作用。經(jīng)前二格處理的糞液進(jìn)入第三池，基本上已經(jīng)不含寄生蟲卵和病原微生物，達(dá)到了糞便無害化要求，可以供農(nóng)田直接施肥。
長期不清理化糞池的危害：
化糞池是處理糞便并加以過濾沉淀的設(shè)備。其原理是固化物在池底分解，上層的水化物體，進(jìn)入管道流走，防止了管道堵塞?；S池長期不清理，首先就是分解之后產(chǎn)生的大量氣體，其中有易燃易爆的甲烷和其他有毒、有異味的氣體影響居住環(huán)境，還有隱患。而且異味問題會很頭疼，誰都不愿意生活在滿是穢物異味的環(huán)境里。
化糞池太久不清理會漏出來，化糞池長期不清理池底積累過量污物，有可能會滲到地底，污染地下水源，給周圍的水系環(huán)境帶來嚴(yán)重的破壞。也會漏出地面，影響生活起居和工廠作業(yè)。所以說要定期清理化糞池。