履約保證金必須游離在工程造價之外，只作為中標方違約時招標方損失的補償，招標人必須是具備招標能力的法人，其建設資金已經(jīng)到位，不能把履約保證金作為工程造價的補充。因此，履約保證金具有獨立性，必須由雙方認可的機構負責收繳、儲存、執(zhí)行和返還。

履約保證金一般來自承包方的流動資金，在施工前付給發(fā)包方。質(zhì)量保證金是發(fā)包方與承包方在建設工程承包合同中約定或承包方在工程保修書中承諾，在工程竣工驗收交付使用后，從應付的建設工程款中預留的用以維修工程在保修期限和保修范圍內(nèi)出現(xiàn)的質(zhì)量缺陷的資金。

商業(yè)保函的費用相對于銀行辦函要便宜很多，有的可能低于50%以上。這對于建筑企業(yè)來說，相對還是比較節(jié)約成本的。銀行保函是由銀行直接出具的，屬于銀行信用，而商業(yè)保函是由專業(yè)的擔保機構或商業(yè)機構出具的，屬于商業(yè)信用。

加工貿(mào)易稅款保付保函是指在申請人的來料加工、來件裝配、來樣生產(chǎn)及進料等加工業(yè)務項下，銀行擔保申請人在海關享受免稅進口復出口待遇的擔保。它是專門針對，需要向海關繳納關稅及其他稅費保證金的加工貿(mào)易企業(yè)（包括來料加工企業(yè)和三資企業(yè)），而開辦的一項手續(xù)便捷、費用低廉的特色業(yè)務。簡而言之，就是以銀行擔保函來替代實存保證金。