另一種是通過擔保公司來辦理銀行保函，出具一定的手續(xù)費，使用擔保公司在銀行的授信額度來辦理。通常這種方式要比直接去銀行辦理要快很多，快的能2-3天出函，當然也有當天出函的。此外，通過擔保公司來辦理銀行保函同樣可以解決企業(yè)資金周轉困難的難題，能夠讓企業(yè)更多的資金用在工程建設和貿易采購上邊。
把保函與跟單信用證相比，當事人的權利和義務基本相同，所不同的是跟單信用證要求受益人提交的單據是包括運輸單據在內的商業(yè)單據，而保函要求的單據實際上是受益人出具的關于委托人違約的聲明或證明。這一區(qū)別，使兩者適用范圍有了很大的不同，保函可適用于各種經濟交易中，為契約的一方向另一方提供擔保。另外，如果委托人沒有違約，保函的擔保人就不必為承擔賠償責任而付款。而信用證的開證行則必須先行付款。
銀行保函有以下兩個特點：
1、保函依據商務合同開出，但又不依附于商務合同，具有獨立法律效力。當受益人在保函項下合理索賠時，擔保行就必須承擔付款責任，而不論委托人是否同意付款，也不管合同履行的實際事實。即保函是獨立的承諾并且基本上是單證化的交易業(yè)務。
2、銀行信用作為保證，易于為合同雙方接受。
預付款銀行保函是指以銀行信用為擔保，由銀行向甲方出具的擔保函，但乙方違約時，由銀行向甲方進行賠付。目前，預付款銀行保函主要是建設銀行開具，支持全國使用。也有部分甲方要求必須為當地銀行開具的，這種情況可以通過擔保公司代為辦理。同時，部分項目會要求采用基本戶所在銀行開具的保函，如果基本戶所在銀行不提供銀行保函辦理業(yè)務，可以通過擔保公司代為辦理。
