工程保函是依據商務合同開出的，但又不依附于商務合同，是具有獨立法律效力的法律文件。當受益人在保函項下合理索賠時，擔保人就必須承擔付款責任，而不論申請人是否同意付款，也不管合同履行的實際事實，即保函是獨立的承諾并且基本上是單證化的交易業(yè)務。
簡單辨認獨立保函：“一般無條件”、“見索即付”、“不依附合同生效”、“保函是獨立的”或“本函適用《國際商會見索即付保函統(tǒng)一規(guī)則》”等字樣的，基本可以確定本保函格式為獨立保函。
另外，人民法院不支持當事人以下主張：
1.當事人以獨立保函記載了對應的基礎交易為由，主張該保函性質為一般保證或連帶保證的；
2.當事人主張獨立保函適用擔保法關于一般保證或連帶保證規(guī)定的。
銀行出具的保證通常稱為保函，其他保證人出具的書面保證一般稱為保證書。保證在申請人未能按雙方協(xié)議履行其責任或義務時，由擔保人代其履行一定金額、一定期限范圍內的某種支付責任或經濟賠償責任。保函即為保證書，為了方便，一般公司及銀行都印有一定格式的保證書，其作用包括憑保函交付貨物、憑保函簽發(fā)清潔提單、憑保函倒簽預借提單等。