醫(yī)院設(shè)有眼底科、青光眼科、眼外傷科、白內(nèi)障中心、視光中心、眼角膜科、眼腫瘤科、眼肌科、眼中醫(yī)科、眼整形科、臨床檢查中心、中心防盲辦公室、同仁眼庫、北京市眼科研究所、耳科、鼻科、喉科、頭頸外科、中心防聾辦公室、北京市耳鼻咽喉科研究所、變態(tài)反應(yīng)科、心內(nèi)科、心外科、神經(jīng)內(nèi)科、消化內(nèi)科、呼吸內(nèi)科、腎內(nèi)科、內(nèi)分泌科、血液科、風(fēng)濕免疫科、感染科等科室。

其中眼科、耳鼻咽喉科為原衛(wèi)生部批準(zhǔn)的國家臨床重點(diǎn)?？?，變態(tài)反應(yīng)科為國家衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會批準(zhǔn)的國家臨床重點(diǎn)?？?，中醫(yī)眼科學(xué)為國家中醫(yī)藥管理局批準(zhǔn)的中醫(yī)重點(diǎn)學(xué)科。

青光眼科一直以來就是同仁眼科的重點(diǎn)專業(yè)。多年來，在國內(nèi)眼科學(xué)界長期占據(jù)優(yōu)勢地位，并在國際上享有一定的影響力。目前，青光眼科是中華醫(yī)學(xué)會眼科學(xué)分會青光眼學(xué)組組長單位，也是中國醫(yī)師協(xié)會眼科學(xué)分會青光眼委員會主任委員單位。

青光眼科主要的特點(diǎn)和優(yōu)勢是注重臨床和科研相結(jié)合。在保持原有臨床技術(shù)優(yōu)勢的情況下，注重基礎(chǔ)科研工作，在國內(nèi)學(xué)術(shù)界具有優(yōu)勢。

北京同仁醫(yī)院眼外傷?？瞥闪⒂?968年，是國內(nèi)早成立的集臨床、科研、教學(xué)于一體的眼外傷?？啤１本┩恃弁鈧麑？萍夹g(shù)力量雄厚，學(xué)科梯隊(duì)合理，擁有包括多位經(jīng)驗(yàn)豐富、享有盛譽(yù)的專家和教授在內(nèi)的近20名副主任醫(yī)師以上職稱的高級專業(yè)人才。每月專家門診量在1700人次以上，固定病床50余張，年手術(shù)量達(dá)5000人次以上。

角膜塑形鏡門診現(xiàn)設(shè)立在北京同仁醫(yī)院崇文門院區(qū)東區(qū)一樓視光中心門診，隸屬眼科醫(yī)學(xué)視光中心，現(xiàn)有醫(yī)生6人，均為副高以上職稱，專業(yè)擅長為眼視光醫(yī)學(xué)及角膜病學(xué)，在復(fù)雜角膜屈光問題，近視眼防控，角膜塑形鏡驗(yàn)配，硬性角膜接觸鏡(RGP)驗(yàn)配等領(lǐng)域具有豐富的臨床經(jīng)驗(yàn)。

服務(wù)人群：18-55歲的近視、散光、遠(yuǎn)視等屈光不正，希望通過手術(shù)矯正獲得更好視覺體驗(yàn)的患者。