醫(yī)院建成于1921年，由洛克菲勒基金會創(chuàng)辦。建院之初，就志在“建成亞洲的醫(yī)學中心”。同時，北京協(xié)和醫(yī)院是洛克菲勒基金會在海外單項撥款數(shù)目、時間延續(xù)長的慈善援助項目 [8] [16]

2019年12月，中國醫(yī)學科學院在北京發(fā)布了《2018年度中國醫(yī)院科技量值報告》，北京協(xié)和醫(yī)院科技量值排名位列前3位。 [9]

2017年11月11日下午，復旦大學醫(yī)院管理研究所正式發(fā)布了《2016年度中國醫(yī)院排行榜》和《2016年度中國醫(yī)院?？坡曌u排行榜》，北京協(xié)和醫(yī)院名列榜首 [1] 。2020年4月，被列入北京市面向團體和個人提供新冠病毒核酸檢測服務醫(yī)療機構(gòu)名單。 [4]

2022年10月8日，北京協(xié)和醫(yī)院緩和醫(yī)學中心成立。

北京協(xié)和醫(yī)院風濕免疫科是我國早成立風濕病學的專業(yè)科室之一，擁有多位全國知名的專家和教授。風濕免疫科是國家教委風濕病專業(yè)全國重點學科。風濕免疫科有一大批教授和知名醫(yī)師活躍在醫(yī)教研線，構(gòu)成了風濕免疫科強大的團隊，在國內(nèi)外享有盛譽。

科室現(xiàn)已整體搬至協(xié)和醫(yī)院西院區(qū)，有病區(qū)2層，床位68張；科內(nèi)設有常規(guī)實驗室和科研實驗室，可以檢測近百種自身抗體，為國內(nèi)的自身抗體檢測中心之一。出診醫(yī)師正副教授10余人，主治醫(yī)師10余人，分別在西院區(qū)普通、特需和夜門診出診。為全國眾多風濕免疫病和疑難重癥患者解決疾苦。

2017年11月11日下午，復旦大學醫(yī)院管理研究所正式發(fā)布了《2016年度中國醫(yī)院排行榜》和《2016年度中國醫(yī)院?？坡曌u排行榜》。在入榜的100家醫(yī)院中，有37個是專科醫(yī)院，北京協(xié)和醫(yī)院位列。 [1]

2019年11月10日，復旦版《2018年度中國醫(yī)院排行榜》發(fā)布，北京協(xié)和居首。 [3]

2021年11月20日，復旦版《2020年度中國醫(yī)院綜合排行榜》正式發(fā)布，北京協(xié)和醫(yī)院穩(wěn)居。