北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所與醫(yī)院主體并稱“一院三所”，成為集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防、國際交流五位一體的醫(yī)療科研聯(lián)合體。眼科、耳鼻咽喉科為教育部批準(zhǔn)的國家臨床重點(diǎn)學(xué)科，變態(tài)反應(yīng)(鼻過敏)科為原國家衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會批準(zhǔn)的國家臨床重點(diǎn)專科，中醫(yī)眼科學(xué)為國家中醫(yī)藥管理局批準(zhǔn)的中醫(yī)重點(diǎn)學(xué)科。首都醫(yī)科大學(xué)北京眼科學(xué)院和耳鼻咽喉科學(xué)院設(shè)在院內(nèi)。醫(yī)院設(shè)有世界衛(wèi)生組織防盲合作中心和世界衛(wèi)生組織防聾合作中心，附設(shè)北京同仁眼庫(國際眼庫協(xié)會會員)。

在科研方面，近年來，在原發(fā)性閉角型青光眼和原發(fā)性開角型青光眼發(fā)病機(jī)制和早期診斷方面做出重大成績，其科研成果連續(xù)獲得2013年和2014年國家科技進(jìn)步二等獎兩項(xiàng)，2012年中華醫(yī)學(xué)獎一等獎一項(xiàng)，北京科技進(jìn)步二等獎一項(xiàng)。同時多人多項(xiàng)目承擔(dān)國家和北京市重點(diǎn)科研項(xiàng)目。

北京同仁醫(yī)院眼外傷?？萍瘞状弁鈧说目偨Y(jié)積累、幾十年的臨床實(shí)踐診治經(jīng)驗(yàn)，業(yè)已形成一套具有自身特色的、在國內(nèi)外業(yè)界具有良好口碑的眼外傷診斷常規(guī)，現(xiàn)已發(fā)展成為我國規(guī)模大、綜合技術(shù)力量強(qiáng)的眼外傷專科。眼外傷專科除開展一般常見疾病手術(shù)如：白內(nèi)障摘除、人工晶狀體植入，晶狀體脫位半脫位摘除、人工晶狀體/張力環(huán)脫位半脫位復(fù)位、玻璃體切除，眼內(nèi)異物取出，視網(wǎng)膜嵌頓、視網(wǎng)膜脫離復(fù)位等手術(shù)外，還廣泛開展了各種復(fù)雜眼外傷的前后段聯(lián)合手術(shù)，善于接診各類眼外傷疑難雜癥和重急癥患者，在眼外傷后各種疑難高危復(fù)雜玻璃體視網(wǎng)膜病變、眼前節(jié)紊亂、眼球早期萎縮、眼后房微小異物、感染性眼病、復(fù)雜性虹膜睫狀體病變以及嚴(yán)重眼化學(xué)傷等眼外傷相關(guān)疾病的診治水平處于國際水平，是國內(nèi)復(fù)雜性眼外傷患者的轉(zhuǎn)診中心，使許多以往無法醫(yī)治的眼底、眼外傷復(fù)雜疑難病癥得到成功的救治。

北京同仁醫(yī)院眼科屈光手術(shù)中心在原衛(wèi)生部的批準(zhǔn)和支持下，于1993年率先在國內(nèi)開展了近視眼、遠(yuǎn)視眼、散光及弱視的成因及角膜屈光矯治手術(shù)。時至今日，已成為國內(nèi)每年完成屈光矯正類手術(shù)門診和手術(shù)總量多的屈光?？疲菄鴥?nèi)，具有國際影響力的屈光手術(shù)診療中心之一。

中心擁有一支實(shí)力雄厚的專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì)，現(xiàn)有醫(yī)生8人，醫(yī)技9人，驗(yàn)光師2人，護(hù)士1人。具有博士學(xué)歷人員5人、碩士學(xué)歷人員7人、本科學(xué)歷人員8人。其中教授和主任醫(yī)師3人，副教授和副主任醫(yī)師4人，主治醫(yī)師1人，副主任技師1人，主管技師9人。博士生導(dǎo)師1人，已培養(yǎng)博士研究生、碩士研究生100余人，進(jìn)修醫(yī)生百余名。

為了大限度滿足患者門診、手術(shù)的需求，中心實(shí)行全年無限號門診，2017年門診量達(dá)6萬多人次，年手術(shù)量近1.5萬例。技術(shù)團(tuán)隊(duì)多年來積累了大量的臨床手術(shù)及并發(fā)癥處理方面的經(jīng)驗(yàn)。