保證金存在被收取者挪用的風險，而且對是否挪用難以監(jiān)控。雖然法律上明文規(guī)定保證金不允許挪用，但事實上或多或少，無論是招標代理機構，還是招標人，什么有些政府交易平臺，都存在一些保證金挪用的現(xiàn)象，如果挪用的大額保證金不能及時歸還，對投標人會造成損失。
投標人由于需要到處參加投標，保證金交納筆數(shù)多了以后，累計數(shù)額也是不小的。或多或少影響了投標人的現(xiàn)金流，一方面造成這些資金的無效沉淀，一方面在投標人資金緊張后又加大了它外部融資的成本，間接提高企業(yè)的生產成本，招標人的采購價格。
保證金除非被惡意提取，否則不存在被挪用的情況，而提取手續(xù)相對正規(guī)，提取行為一定也會告知投標人，如果該項目不存在扣保證金的理由，投標人可以及時申訴，避免挪用造成的財產損失。
投標保函開具的成本并不高。鑒于投標保證金被扣除的概率不高，銀行對此類保證金的條件要求其實不高，和我們理解的信貸額度還是在制度及押款比例上有相當大的區(qū)別，另外已經(jīng)有一些企業(yè)通過與銀行的合作，通過提供銀行的信用擔保等方式推出相關的金融服務，這些都會大大降低投標人的資金占壓數(shù)量。