高新技術(shù)企業(yè)認定審計肯定是在高新技術(shù)企業(yè)的基礎(chǔ)上才能去操作的，所以，想要申報高新技術(shù)企業(yè)認定審計，首先需要認定企業(yè)為高新技術(shù)企業(yè)。一定要先認定為高新技術(shù)企業(yè)，才能申報高新技術(shù)企業(yè)認定審計。

高新技術(shù)企業(yè)專項審計，是依據(jù)高新技術(shù)企業(yè)認定辦法相關(guān)規(guī)定，對近三年的研發(fā)費用支出情況及高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入情況進行審計，出具審計專項報告。該報告主要用于企業(yè)申辦高新技術(shù)企業(yè)或高新技術(shù)企業(yè)復(fù)審使用。提供給科委、財政、稅務(wù)、工商單位及管理層和董事會等相關(guān)。

申報明細表又區(qū)別于年度財務(wù)報表。企業(yè)近三個會計年度研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細表和近一年高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入明細表是按照《高新技術(shù)企業(yè)認定管理辦法》和《高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作指引》編制的，其列報的數(shù)據(jù)可以直接反映出企業(yè)是否滿足認定條件。

不論企業(yè)以前年度財務(wù)報表是否委托注冊會計師進行審計，還是專項審計與年度財務(wù)報表審計是否為同一家會計師事務(wù)所承接，專項審計都可以按照《專項審計指引》獨立實施審計程序。如果結(jié)合以前年度財務(wù)報表審計，確定的重要性水平應(yīng)當?shù)陀谙鄳?yīng)財務(wù)報表審計的重要性水平，確定審計范圍時應(yīng)當考慮擬利用以前年度財務(wù)報表審計工作中獲取的審計證據(jù)的程度。需要注意的是，應(yīng)當結(jié)合具體環(huán)境考慮重要性的性質(zhì)和數(shù)量兩方面的因素。