高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定審計(jì)肯定是在高新技術(shù)企業(yè)的基礎(chǔ)上才能去操作的，所以，想要申報(bào)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定審計(jì)，首先需要認(rèn)定企業(yè)為高新技術(shù)企業(yè)。一定要先認(rèn)定為高新技術(shù)企業(yè)，才能申報(bào)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定審計(jì)。

不論企業(yè)以前年度財(cái)務(wù)報(bào)表是否委托注冊(cè)會(huì)計(jì)師進(jìn)行審計(jì)，還是專項(xiàng)審計(jì)與年度財(cái)務(wù)報(bào)表審計(jì)是否為同一家會(huì)計(jì)師事務(wù)所承接，專項(xiàng)審計(jì)都可以按照《專項(xiàng)審計(jì)指引》獨(dú)立實(shí)施審計(jì)程序。如果結(jié)合以前年度財(cái)務(wù)報(bào)表審計(jì)，確定的重要性水平應(yīng)當(dāng)?shù)陀谙鄳?yīng)財(cái)務(wù)報(bào)表審計(jì)的重要性水平，確定審計(jì)范圍時(shí)應(yīng)當(dāng)考慮擬利用以前年度財(cái)務(wù)報(bào)表審計(jì)工作中獲取的審計(jì)證據(jù)的程度。需要注意的是，應(yīng)當(dāng)結(jié)合具體環(huán)境考慮重要性的性質(zhì)和數(shù)量兩方面的因素。

基于申請(qǐng)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定的目的，申報(bào)企業(yè)通常將近三個(gè)會(huì)計(jì)年度研究開發(fā)費(fèi)用結(jié)構(gòu)明細(xì)表和近一年高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入明細(xì)表的專項(xiàng)審計(jì)同時(shí)委托給一家會(huì)計(jì)師事務(wù)所，《專項(xiàng)審計(jì)指引》要求，針對(duì)研究開發(fā)費(fèi)用結(jié)構(gòu)明細(xì)表和高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入明細(xì)表分別出具專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告。

高新審計(jì)依據(jù)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定辦法相關(guān)規(guī)定，企業(yè)申請(qǐng)高新認(rèn)定，需要對(duì)近三年的財(cái)務(wù)狀況、研發(fā)費(fèi)用支出情況及高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入情況進(jìn)行審計(jì)，出具審計(jì)專項(xiàng)報(bào)告和年度審計(jì)報(bào)告。

會(huì)計(jì)師會(huì)結(jié)合企業(yè)情況，給出一份準(zhǔn)備材料的清單。主要是企業(yè)的資產(chǎn)負(fù)債表、損益表、總賬、明細(xì)賬、科目余額表(到末級(jí)科目)、財(cái)務(wù)憑證、公司的執(zhí)照、章程等等。