高新技術(shù)企業(yè)專項(xiàng)審計(jì)，是依據(jù)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定辦法相關(guān)規(guī)定，對(duì)近三年的研發(fā)費(fèi)用支出情況及高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入情況進(jìn)行審計(jì)，出具審計(jì)專項(xiàng)報(bào)告。該報(bào)告主要用于企業(yè)申辦高新技術(shù)企業(yè)或高新技術(shù)企業(yè)復(fù)審使用。提供給科委、財(cái)政、稅務(wù)、工商單位及管理層和董事會(huì)等相關(guān)。

無(wú)論是研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用，還是高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))，在專項(xiàng)審計(jì)中都涉及高新技術(shù)的識(shí)別。注冊(cè)會(huì)計(jì)師不是高新技術(shù)領(lǐng)域的專家，《專項(xiàng)審計(jì)指引》為此做了如下規(guī)定：

(1)恰當(dāng)界定研究開(kāi)發(fā)項(xiàng)目、高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))的具體范圍是申報(bào)企業(yè)的責(zé)任。

(2)申報(bào)企業(yè)技術(shù)負(fù)責(zé)人與企業(yè)法定代表人、財(cái)務(wù)負(fù)責(zé)人共同簽署《管理當(dāng)局聲明書(shū)》。

但《專項(xiàng)審計(jì)指引》也規(guī)定，制定總體審計(jì)策略時(shí)，應(yīng)當(dāng)清楚地說(shuō)明向具體審計(jì)領(lǐng)域調(diào)配的資源，包括就復(fù)雜的研究開(kāi)發(fā)項(xiàng)目技術(shù)問(wèn)題利用專家的工作。

要求識(shí)別和評(píng)估申報(bào)明細(xì)表層次以及各類交易、列報(bào)認(rèn)定層次的重大錯(cuò)報(bào)風(fēng)險(xiǎn)。申報(bào)明細(xì)表層次重大錯(cuò)報(bào)風(fēng)險(xiǎn)需要從整體上加以判斷，比如，申報(bào)企業(yè)不能提供研究開(kāi)發(fā)項(xiàng)目的相關(guān)計(jì)劃與實(shí)施方案、研究開(kāi)發(fā)記錄，申報(bào)明細(xì)表整體上就可能存在重大錯(cuò)報(bào)風(fēng)險(xiǎn)。申報(bào)明細(xì)表層次重大錯(cuò)報(bào)風(fēng)險(xiǎn)很可能源于薄弱的控制環(huán)境，特別是凌駕于內(nèi)部控制制度之上時(shí)，很可能偽造或篡改編制申報(bào)明細(xì)表所依據(jù)的會(huì)計(jì)記錄或相關(guān)文件。

對(duì)于市場(chǎng)中的企業(yè)來(lái)說(shuō)，其大多知曉企業(yè)申請(qǐng)成為高新技術(shù)企業(yè)的重要意義。并且，企業(yè)申請(qǐng)成為高新技術(shù)企業(yè)，具備諸多好處和優(yōu)勢(shì)。因此，很多符合條件和要求的企業(yè)，都會(huì)有著申請(qǐng)成為高新技術(shù)企業(yè)的意愿與訴求。而這，就需要開(kāi)展高新技術(shù)企業(yè)審計(jì)。