高新技術(shù)企業(yè)是指在《國家重點(diǎn)支持的高新技術(shù)領(lǐng)域》內(nèi)，持續(xù)進(jìn)行研究開發(fā)與技術(shù)成果轉(zhuǎn)化，形成企業(yè)核心自主知識產(chǎn)權(quán)，并以此為基礎(chǔ)開展經(jīng)營活動，在中國境內(nèi)(不包括港、澳、臺地區(qū))注冊一年以上的居民企業(yè)。它是知識密集、技術(shù)密集的經(jīng)濟(jì)實(shí)體。

不論企業(yè)以前年度財務(wù)報表是否委托注冊會計師進(jìn)行審計，還是專項審計與年度財務(wù)報表審計是否為同一家會計師事務(wù)所承接，專項審計都可以按照《專項審計指引》獨(dú)立實(shí)施審計程序。如果結(jié)合以前年度財務(wù)報表審計，確定的重要性水平應(yīng)當(dāng)?shù)陀谙鄳?yīng)財務(wù)報表審計的重要性水平，確定審計范圍時應(yīng)當(dāng)考慮擬利用以前年度財務(wù)報表審計工作中獲取的審計證據(jù)的程度。需要注意的是，應(yīng)當(dāng)結(jié)合具體環(huán)境考慮重要性的性質(zhì)和數(shù)量兩方面的因素。

無論是研究開發(fā)費(fèi)用，還是高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))，在專項審計中都涉及高新技術(shù)的識別。注冊會計師不是高新技術(shù)領(lǐng)域的專家，《專項審計指引》為此做了如下規(guī)定：

(1)恰當(dāng)界定研究開發(fā)項目、高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))的具體范圍是申報企業(yè)的責(zé)任。

(2)申報企業(yè)技術(shù)負(fù)責(zé)人與企業(yè)法定代表人、財務(wù)負(fù)責(zé)人共同簽署《管理當(dāng)局聲明書》。

但《專項審計指引》也規(guī)定，制定總體審計策略時，應(yīng)當(dāng)清楚地說明向具體審計領(lǐng)域調(diào)配的資源，包括就復(fù)雜的研究開發(fā)項目技術(shù)問題利用專家的工作。

1.申請企業(yè)自主選擇第三方審計機(jī)構(gòu)委托業(yè)務(wù)(基于對審計機(jī)構(gòu)業(yè)務(wù)資質(zhì)、服務(wù)團(tuán)隊、客戶口碑的充分了解)；

2.審計代理公司與申請公司進(jìn)行初步溝通了解，確定企業(yè)的審計目的和范圍，再由審計公司對申請企業(yè)的審計風(fēng)險進(jìn)行專業(yè)評估；

3.評估通過后，雙方簽訂正式的審計服務(wù)協(xié)議，明確審計費(fèi)用、雙方的權(quán)利和責(zé)任，并進(jìn)行初步數(shù)據(jù)交接；

4.審計代理公司應(yīng)當(dāng)成立專門的項目組，向受委托企業(yè)發(fā)放高新技術(shù)企業(yè)專項審計所需材料清單；

5.申請人應(yīng)根據(jù)資料清單準(zhǔn)備相關(guān)審核材料；

6.審計代理公司審計工作組根據(jù)企業(yè)數(shù)據(jù)制定高新技術(shù)企業(yè)具體審計工作方案，為審計工作的實(shí)施打下良好基礎(chǔ)；

7.與被審計企業(yè)確定現(xiàn)場審計時間并出具審計通知書；

8.審核員進(jìn)入現(xiàn)場，審核企業(yè)提供的審核資料，對期間發(fā)現(xiàn)的審核問題進(jìn)行詳細(xì)記錄，形成審核工作底稿；

9.審核審計工作底稿，并在此基礎(chǔ)上形成初步意見；

10.與被審計企業(yè)交換審計意見；

11.在雙方一致同意的基礎(chǔ)上，為高新技術(shù)企業(yè)出具專項審計報告。