高新技術(shù)企業(yè)認定審計肯定是在高新技術(shù)企業(yè)的基礎上才能去操作的，所以，想要申報高新技術(shù)企業(yè)認定審計，首先需要認定企業(yè)為高新技術(shù)企業(yè)。一定要先認定為高新技術(shù)企業(yè)，才能申報高新技術(shù)企業(yè)認定審計。

申報明細表與年度財務報表相關(guān)聯(lián)，是指企業(yè)近三個會計年度研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細表和近一年高新技術(shù)產(chǎn)品(服務)收入明細表的相關(guān)數(shù)據(jù)包含在已審計的年度財務報表中，兩者適用的會計準則或會計制度是一致的，在相關(guān)會計政策、會計估計方面不存在差異。

無論是研究開發(fā)費用，還是高新技術(shù)產(chǎn)品(服務)，在專項審計中都涉及高新技術(shù)的識別。注冊會計師不是高新技術(shù)領域的專家，《專項審計指引》為此做了如下規(guī)定：

(1)恰當界定研究開發(fā)項目、高新技術(shù)產(chǎn)品(服務)的具體范圍是申報企業(yè)的責任。

(2)申報企業(yè)技術(shù)負責人與企業(yè)法定代表人、財務負責人共同簽署《管理當局聲明書》。

但《專項審計指引》也規(guī)定，制定總體審計策略時，應當清楚地說明向具體審計領域調(diào)配的資源，包括就復雜的研究開發(fā)項目技術(shù)問題利用專家的工作。

要求識別和評估申報明細表層次以及各類交易、列報認定層次的重大錯報風險。申報明細表層次重大錯報風險需要從整體上加以判斷，比如，申報企業(yè)不能提供研究開發(fā)項目的相關(guān)計劃與實施方案、研究開發(fā)記錄，申報明細表整體上就可能存在重大錯報風險。申報明細表層次重大錯報風險很可能源于薄弱的控制環(huán)境，特別是凌駕于內(nèi)部控制制度之上時，很可能偽造或篡改編制申報明細表所依據(jù)的會計記錄或相關(guān)文件。