高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定專項(xiàng)審計(jì)，是指注冊(cè)會(huì)計(jì)師接受擬向有關(guān)部門申請(qǐng)進(jìn)行高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定的申報(bào)企業(yè)委托，對(duì)其近三個(gè)會(huì)計(jì)年度(實(shí)際經(jīng)營(yíng)不滿三年的按實(shí)際經(jīng)營(yíng)年限)的研究開發(fā)費(fèi)用結(jié)構(gòu)明細(xì)表和近一個(gè)會(huì)計(jì)年度的高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入明細(xì)表進(jìn)行審計(jì)，并出具專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告。

高新技術(shù)企業(yè)是指在《國(guó)家重點(diǎn)支持的高新技術(shù)領(lǐng)域》內(nèi)，持續(xù)進(jìn)行研究開發(fā)與技術(shù)成果轉(zhuǎn)化，形成企業(yè)核心自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)，并以此為基礎(chǔ)開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)，在中國(guó)境內(nèi)(不包括港、澳、臺(tái)地區(qū))注冊(cè)一年以上的居民企業(yè)。它是知識(shí)密集、技術(shù)密集的經(jīng)濟(jì)實(shí)體。

無(wú)論是研究開發(fā)費(fèi)用，還是高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))，在專項(xiàng)審計(jì)中都涉及高新技術(shù)的識(shí)別。注冊(cè)會(huì)計(jì)師不是高新技術(shù)領(lǐng)域的專家，《專項(xiàng)審計(jì)指引》為此做了如下規(guī)定：

(1)恰當(dāng)界定研究開發(fā)項(xiàng)目、高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))的具體范圍是申報(bào)企業(yè)的責(zé)任。

(2)申報(bào)企業(yè)技術(shù)負(fù)責(zé)人與企業(yè)法定代表人、財(cái)務(wù)負(fù)責(zé)人共同簽署《管理當(dāng)局聲明書》。

但《專項(xiàng)審計(jì)指引》也規(guī)定，制定總體審計(jì)策略時(shí)，應(yīng)當(dāng)清楚地說明向具體審計(jì)領(lǐng)域調(diào)配的資源，包括就復(fù)雜的研究開發(fā)項(xiàng)目技術(shù)問題利用專家的工作。

高新審計(jì)依據(jù)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定辦法相關(guān)規(guī)定，企業(yè)申請(qǐng)高新認(rèn)定，需要對(duì)近三年的財(cái)務(wù)狀況、研發(fā)費(fèi)用支出情況及高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入情況進(jìn)行審計(jì)，出具審計(jì)專項(xiàng)報(bào)告和年度審計(jì)報(bào)告。

會(huì)計(jì)師會(huì)結(jié)合企業(yè)情況，給出一份準(zhǔn)備材料的清單。主要是企業(yè)的資產(chǎn)負(fù)債表、損益表、總賬、明細(xì)賬、科目余額表(到末級(jí)科目)、財(cái)務(wù)憑證、公司的執(zhí)照、章程等等。