在電場中液體對于一個固體的固定相相對移動稱為電滲.在有載體的電泳中，影響電泳移動的一個重要因素是電滲。常遇到的情況是γ-球蛋白，由原點向負(fù)極移動，這就是電滲作用所引起的倒移現(xiàn)象.產(chǎn)生電滲現(xiàn)象的原因是載體中常含有可電離的基團(tuán)，如濾紙中含有羥基而帶負(fù)電荷，與濾紙相接觸的水溶液帶正電荷，液體便向負(fù)極移動。由于電滲現(xiàn)象往往與電泳同時存在，所以帶電粒子的移動距離也受電滲影響；如電泳方向與電滲相反，則實際電泳的距離等于電泳距離加上電滲的距離.瓊脂中含有瓊脂果膠，，其中含有較多的硫酸根，所以在瓊脂電泳時電滲現(xiàn)象很明顯，許多球蛋白均向負(fù)極移動。除去了瓊脂果膠后的瓊脂糖用作凝膠電泳時，電滲大為減弱.電滲所造成的移動距離可用不帶電的有色染料或有色葡聚糖點在支持物的中心，以觀察電滲的方向和距離。

電泳介質(zhì)的pH值 溶液的pH值決定帶電物質(zhì)的解離程度，也決定物質(zhì)所帶凈電荷的多少.對蛋白質(zhì)，氨基酸等類似兩性電解質(zhì)，pH值離等電點越遠(yuǎn)，粒子所帶電荷越多，泳動速度越快，反之越慢。因此，當(dāng)分離某一種混合物時，應(yīng)選擇一種能擴大各種蛋白質(zhì)所帶電荷量差別的pH值，以利于各種蛋白質(zhì)的有效分離.為了保證電泳過程中溶液的pH值恒定，必須采用緩沖溶液。

等電聚焦電泳 是將兩性電解質(zhì)加入盛有pH梯度緩沖液的電泳槽中，當(dāng)其處在低于其本身等電點的環(huán)境中則帶正電荷，向負(fù)極移動；若其處在高于其本身等電點的環(huán)境中，則帶負(fù)電向正極移動。當(dāng)泳動到其自身特有的等電點時，其凈電荷為零，泳動速度下降到零，具有不同等電點的物質(zhì)后聚焦在各自等電點位置，形成一個個清晰的區(qū)帶，分辨率。

在確定的條件下，帶電粒子在單位電場強度作用下，單位時間內(nèi)移動的距離（即遷移率）為常數(shù)，是該帶電粒子的物化特征性常數(shù)。不同帶電粒子因所帶電荷不同，或雖所帶電荷相同但荷質(zhì)比不同，在同一電場中電泳，經(jīng)一定時間后，由于移動距離不同而相互分離。分開的距離與外加電場的電壓與電泳時間成正比。