無菌實驗室設(shè)計的各項建筑物應(yīng)堅固耐用、易于維修、易于清潔，并有能防止食品、食品接觸面及內(nèi)包裝材料遭受污染(如有害動物的侵入、棲息、繁殖等)的結(jié)構(gòu)。

為防止交叉污染，應(yīng)分別設(shè)置人員通道及物料運輸通道，人員通道應(yīng)按潔凈室通道要求（參考上圖）嚴格執(zhí)行，各通道應(yīng)裝有空氣幕(即風幕)或雙向彈簧門及電子滅蠅(蚊)器等防蟲設(shè)施。

無菌工作區(qū)有用無菌操作臺，沒有的話也可以用潔凈工作臺代替。需要放置在離門遠的地方。

無菌實驗室設(shè)計的地面應(yīng)使用、不滲水、不吸水、防滑、無裂隙且易于清洗的建筑材料鋪砌(如耐酸磚、水磨石、混凝土等)，地面應(yīng)有適當坡度(以1.0~1.5%為宜)。

無菌實驗室是實驗室內(nèi)用于無菌操作的小室，其內(nèi)部裝飾、條件要求更嚴格。 1、無菌實驗室應(yīng)每次使用前后用0.1%苯扎溴銨溶液或2%甲醛液擦拭工作臺面及可能污染的死角，濕拖地面，打開無菌空氣過濾器及超凈工作臺的開關(guān)30分鐘，紫外線燈照射1小時。

操作人員用肥皂洗手后進入緩沖間換拖鞋，用75%乙醇棉球擦手，穿戴工作衣帽、口罩。將所需物品剝?nèi)ヅＦぜ埣巴獍b，從傳遞窗移入操作間，再用0.1%苯扎溴銨溶液泡手后進入操作間，在乙醇(或煤氣燈)火焰區(qū)(火焰高度3-5cm)操作。