微生物實驗室自成一區(qū)，與其他實驗室分開，門口設有門禁，只有相關人員刷卡后才能進入。微生物實驗室面積310㎡，設有一間局部百級的檢測室，一間檢測室，一間致病菌檢測室，一間洗刷室，一間霉菌培養(yǎng)室，一間培養(yǎng)室，一間微生物儀器鑒定室，一間培養(yǎng)基制備室，一間菌種保存室。

為控制人員的出入（人流），只設有一個密封門進入微生物實驗室主潔凈區(qū)，操作人員進入物流走廊然后進入準備間，并從準備間分別經過一更、緩沖進入操作區(qū)；經過更衣、風淋、緩沖進入局部百級實驗室。物流則由六個傳遞窗實現。

整個平面布局完全能夠滿足國家相關規(guī)范及實驗室使用的要求，充分利用了空間，按照實驗操作流程配備了各種功能的房間，操作線路方便快捷。

凈化空調系統(tǒng)能夠做到控制實驗室內溫度、塵埃、、有害氣體的濃度和氣流分布，保證室內人員所需新風量和室內合理的氣流流向，并能維持整個食品微生物實驗室合適的梯度壓力和定向流動，實現“無菌環(huán)境保障體系”的目的，減少實驗全過程中一切潛在的感染危險。

微生物實驗室由準備室、洗滌室、室、無菌室、恒溫培養(yǎng)室和普通實驗室六部分組成。較完善的微生物實驗室一般應具備無菌實驗室、凈化實驗室、實驗室等，凈化實驗室應采用封閉過濾，通風方式、吊頂、隔墻、圍護全部采用彩鋼板，地面作環(huán)氧樹脂自流平處理，并設置非凈化區(qū)、更衣區(qū)、凈化區(qū)。