因為正常的銀行保函是需要在該銀行有一定存款做為保證金的，如果申請人違約了，銀行在向招標人支付違約金的同時，也會從投標人的帳戶中扣除相應的保證金。但是由于大多數(shù)投標人并沒有多余的資金存在銀行帳戶，而且存了錢的銀行也不一定能夠開保函，因此，投標人很難自己直接從銀行申請辦理保函。

預付款保函是保證在甲方支付了預付款之后能收到合同約定的效果，也即在甲方支付了預付款之后如乙方?jīng)]有履行合同，銀行則將預付款保函的相應押金交還給甲方作為損失補償。

預付款保函在國際承包業(yè)務中使用時，是由承包人通過銀行向業(yè)主提供。保證書規(guī)定，如申請人不履行他與受益人訂立的合同的義務，不將受益人預付、支付的款項退還或還款給受益人，則由銀行向受益人退還該款項。

預付款保函除在國際工程承包項目中使用外，也適用于貨物進出口、勞務合作和技術(shù)貿(mào)易等業(yè)務。例如，在成套設(shè)備及大型交通工具的合同中，通常采用帶有預付性質(zhì)的分期付款或延期付款支付部分價款。