無菌車間又叫無菌室，它的要求更高，除了按潔凈室要求處理空氣中微粒外，還需要對室內(nèi)空氣進(jìn)行處理，即同時(shí)要去除生物污染源，對室檢查還需要對室內(nèi)空氣采樣培養(yǎng)，以杜絕感染源。醫(yī)院手術(shù)室、血液透析室、藥品及三類一次性醫(yī)療用品生產(chǎn)都要求使用無菌室；但是檢測時(shí)需要檢測浮游菌、沉降菌等菌落數(shù)。

無菌定義是要求沒有活體微生物的存在，為了達(dá)到無菌車間內(nèi)沒有活體微生物，無菌車間在產(chǎn)品制造過程中需要采取各種方法來去除制品中原有的微生物和防止制品受到微生物的污染。那么，在無菌車間中，使空間內(nèi)達(dá)到無菌要求，就是室內(nèi)環(huán)境控制的重點(diǎn)?？刂莆⑸锏纳L、殺滅或去除微生物的方法通常有兩種，一種為化學(xué)類，另一種為物理類。其中，化學(xué)方法有化學(xué)劑、氣化雙氧水、臭氧和環(huán)氧乙烷等；物理方法有濕熱或干熱、輻射和過濾等。

無塵無菌包裝分成大包裝和小包裝兩種，前者包裝容量為5-220L ，可到1000L，主要供食品廠家進(jìn)行分裝銷售;后者包裝容量為70-1200ml，供市場銷售，直接供應(yīng)消費(fèi)者。

無塵無菌包裝包括包裝材料的無塵無菌、包裝產(chǎn)品的無塵無菌、包裝環(huán)境的無塵無菌和包裝后完整封合四個要素.“無塵無菌”表明了產(chǎn)品中不含任何影響產(chǎn)品質(zhì)量 的微生物,“完整封合”表明了經(jīng)過適當(dāng)?shù)臋C(jī)械手段將產(chǎn)品封合到一定容積的包裝內(nèi),能防止微生物和氣體或水蒸汽進(jìn)入包裝。

一方面是徹底，另一方面防止污染，是無菌技術(shù)的兩個方面。另外，還要防止所研究的微生物，特別是致病微生物或經(jīng)過基因工程改造了的本來自然界不存在的微生物從實(shí)驗(yàn)容器中逃逸到外界環(huán)境中去。為了這些目的，在微生物學(xué)中，有許多措施。