（1）生物難降解物質(zhì)多：制藥廢水中含有有機污染污染物大部分屬于生物較難降解的物質(zhì)，例如鹵素化合物、醚類化合物、硝基化合物和一些雜環(huán)化合物等。
（2）廢水色度高：制藥廢水中有相當(dāng)一部分廢水色度很高，有顏色的廢水本身就表明水體中含有特定的污染物；另外有色廢水可以阻截光線在水中的通行，從而影響水生物的生長，同時還抑制由日光催化分解有機物質(zhì)的自然凈化能力。
（3）有毒有害物質(zhì)：制藥廢水中有較多的有機污染物是對水中的生物有害的，例如鹵素化合物、硝基化合物、具有作用的分散劑和表面活性劑等等。
（4）水質(zhì)成分復(fù)雜：醫(yī)藥生產(chǎn)的特點是流程長、過程復(fù)雜、富產(chǎn)品多、反應(yīng)原料常為溶劑類物質(zhì)和環(huán)狀的化合物，使廢水由污染物的分組變得復(fù)雜，加深了廢水的處理難度。
（5）廢水中污染物質(zhì)含量高：制藥工業(yè)生產(chǎn)過程中需要大量使用各種化工原料，但由于多步反應(yīng)、原料利用率低，大部分隨廢水排放，往往造成廢水中污染物的含量居高不下。在醫(yī)藥工業(yè)中，COD濃度為幾萬、幾十萬毫克/升的廢水是經(jīng)?？梢砸姷降?。
生物制藥廢水處理方法
制藥廢水是屬于有機污染物的廢水，主要處理對象為COD、BOD5、生物降解和生物降解緩慢的有機物。
生物制藥廢水的處理方法有生物處理法、物理處理法、化學(xué)處理法等等。
雖說制藥廢水的可生化性較差，但經(jīng)過處理后仍屬科生物降解的有機廢 水、其處理方法一般以生物處理法為主，物化處理法和化學(xué)處理法為次。
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