無(wú)菌室一般為4 — 5 平方米、高 2.5 米的獨(dú)立小房間（與外間隔離），專辟于微生物實(shí)驗(yàn)室內(nèi)，可以用板材和玻璃建造。無(wú)菌室外要設(shè)一個(gè)緩沖間，錯(cuò)開(kāi)門向，以免氣流帶進(jìn)雜菌。無(wú)菌室和緩沖間都必須密閉、室內(nèi)裝備的換氣設(shè)備必須有空氣過(guò)濾裝置。在獲得了無(wú)菌環(huán)境和無(wú)菌材料后，只有保持無(wú)菌狀態(tài)，才能對(duì)某種特定的已知微生物進(jìn)行研究。

無(wú)菌室內(nèi)的地面、墻壁必須平整，不易藏污納垢，便于清洗。工作臺(tái)的臺(tái)面應(yīng)該處于水平狀態(tài)。無(wú)菌室和緩沖間都裝有紫外線燈，無(wú)菌室的紫外線燈距離工作臺(tái)面 1 米。工作人員進(jìn)入無(wú)菌室應(yīng)穿滅過(guò)菌的服裝，戴帽子。

在條件較困難的地方，也可以用木制無(wú)菌箱代替超凈臺(tái)。無(wú)菌箱結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單，便于移動(dòng)，箱正面開(kāi)有兩個(gè)洞，不操作時(shí)用推拉式小門擋住，操作時(shí)可以將雙臂伸進(jìn)去。正面上部裝有玻璃，便于在內(nèi)部操作，箱內(nèi)部裝有紫外線燈，從側(cè)面小門可以放進(jìn)去器具和菌種等。

無(wú)菌室前，應(yīng)將所有物品置于操作之部位（待檢物例外），然后打開(kāi)紫外燈30分鐘，時(shí)間一到，關(guān)閉紫外燈待用

進(jìn)入無(wú)菌室前，必須于緩沖間更換過(guò)的工作服、工作帽及工作鞋。

操作應(yīng)嚴(yán)格按照無(wú)菌操作規(guī)定進(jìn)行，操作中少說(shuō)話，不喧嘩，以保持環(huán)境的無(wú)菌狀態(tài)。

吸取菌液時(shí)，必須用吸耳球吸取，切勿直接用口接觸吸管，如吸管碰到手及其它未的物體，必須重 新 更 換 ，以 防污染 。