通常情況下報告的部門要根據你拆除廠房之前是屬于什么行業(yè)是否有危險性，對應性判斷一下再跟相關部門報告，通常拆遷是需要注銷房產證的，廠房自行拆除的房屋辦理房產注銷的具體步驟如下：

1、是否符合城建規(guī)劃和消防規(guī)范？此項不符合就需要向”規(guī)劃局“報告

2、是否有國土規(guī)劃和施工許可證？不符合就需要”國土局“報告

3、是否符合環(huán)保要求？不符合就需要”環(huán)保局“報告

4、以上三點不符合的就需要申請人為個人的，提供個人身份證明。證明房屋權滅失的材料及申請注銷的《房屋權證》報告。

5、如屬拆遷公司需提交《拆遷許可證》或拆遷公告等相關方書（需拆遷單位蓋章或原件核對）。